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miRNA與靶基因 已有2人參與
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我構(gòu)建了一個(gè)植物（取全部組織）的miRNA文庫，找公司給我分析的數(shù)據(jù)。有一個(gè)miRNA是我想繼續(xù)做下去的，但公司給我預(yù)測(cè)的靶基因是個(gè)文庫里的序列，我用RNAhybrid比較發(fā)現(xiàn)配對(duì)結(jié)果一般： 我無意間發(fā)現(xiàn)我想做的這個(gè)miRNA與我以前做過的一個(gè)基因的匹配結(jié)果非常好： 我的問題是： 1、我還有必要做公司給我預(yù)測(cè)的那個(gè)靶基因嗎？如果要進(jìn)行下一步驗(yàn)證，起碼要滿足什么標(biāo)準(zhǔn)？ 2、miRNA與基因如果完全匹配，是否就意味著這個(gè)基因100%就是miRNA的靶基因呢？還是必須要經(jīng)過進(jìn)一步的試驗(yàn)驗(yàn)證？ 3、在植物上除了RLM-5’RACE法驗(yàn)證靶基因，還有什么方法可以，請(qǐng)簡(jiǎn)單介紹下。 請(qǐng)有實(shí)踐經(jīng)驗(yàn)的蟲友多多指教，勿用百度的結(jié)果來參和�。。≈x謝�。�！ |
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2樓2014-03-09 01:16:22
yuehedou
木蟲 (小有名氣)
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我覺得可以優(yōu)先做你自己那個(gè)匹配度更高的基因~一個(gè)micro可能有多個(gè)靶基因，公司預(yù)測(cè)的那個(gè)也不見得是錯(cuò)的，不過匹配度更高應(yīng)該更可靠。 另外驗(yàn)證時(shí)更經(jīng)典的是可以用構(gòu)建突變株的方式驗(yàn)證吧，這樣可以從功能上驗(yàn)證，不過難度大了些。。。 |
3樓2014-03-09 11:36:27
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