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dnvcqw新蟲 (初入文壇)
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[求助]
求擬南芥U6序列 已有1人參與
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如題，因?yàn)閷?shí)驗(yàn)需要需要內(nèi)參，但但查到序列又不完全一致，還請有誰做過這個(gè)實(shí)驗(yàn)的幫個(gè)忙，先謝了！ [ 發(fā)自手機(jī)版 http://www.gaoyang168.com/3g ] |
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biostar2009
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
dnvcqw(kx444555代發(fā)): 金幣+3, 鼓勵(lì)交流 2014-03-26 09:49:41
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dnvcqw(kx444555代發(fā)): 金幣+3, 鼓勵(lì)交流 2014-03-26 09:49:41
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這種基因的序列確實(shí)不太好查，但是也有辦法 你在NCBI Nucleotide 欄下，用U6 small nuclear RNA) AND "Arabidopsis thaliana" 6.7.8條目 6. Arabidopsis thaliana U6-29 snRNA gene 855 bp linear DNA Accession: X52529.1 GI: 16518 GenBank FASTA Graphics Related Sequences Select item 16517 7. Arabidopsis thaliana U6-26 snRNA gene 914 bp linear DNA Accession: X52528.1 GI: 16517 GenBank FASTA Graphics Related Sequences Select item 16516 8. Arabidopsis thaliana U6-1 snRNA gene 795 bp linear DNA 你再點(diǎn)進(jìn)去看看，大小明顯不對，U6 100 nt差不多了，不可能這么大 但是人家還有Ref REFERENCE 1 (bases 257 to 648) AUTHORS Waibel,F. and Filipowicz,W. TITLE U6 snRNA genes of Arabidopsis are transcribed by RNA polymerase III but contain the same two upstream promoter elements as RNA polymerase II-transcribed U-snRNA genes JOURNAL Nucleic Acids Res. 18 (12), 3451-3458 (1990) PUBMED 2362802 你再進(jìn)去看看這篇paper，八成這些序列也是他上傳的 然后你就可以看見其中的緣由了 不管怎么樣 U6是這樣一段： GTCCCTTCGGGGACATCCGATAAAATTGGAACGATACAGAGAAGATTAGCATGGCCCCTGCGCAAGGATGACACGCATAAATCGAGAAATGGTCCAAATTTT |
» 本帖已獲得的紅花（最新10朵）
dnvcqw2樓2014-03-25 20:18:26
dnvcqw
新蟲 (初入文壇)
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3樓2014-03-26 19:41:51
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4樓2018-09-26 17:34:43
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