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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 計算模擬區(qū) » 分子模擬 » 其他 » 分子靜力學計算
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houzile0金蟲 (小有名氣)
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[求助]
分子靜力學計算
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哪位大神有分子靜力學計算的資料啊，分子靜力學計算是用什么軟件呢，和分子動力學有什么區(qū)別呢 ES勢壘的靜力學計算 我們首先對整個晶胞做弛豫,給出初始的穩(wěn)定晶胞,然后把增原子放在臺階，上.靜力學模擬中,晶胞原子都是自由的;對于增原子,我們在起點(臺階邊緣)和終點之間,沿著擴散路徑(x方向)畫一條直線;從起點開始,每隔0.1ax取一個點.使增原子在每一點處的x坐標固定(這個坐標就是反應路徑),而垂直于擴散路徑的兩個坐標(y,z坐標)則可以自由變化.這樣通過MD模擬,可以得到每一個垂直于反應路徑的平面上的系統(tǒng)的勢能最小值(即系統(tǒng)的結合能).我們以反應路徑為橫坐標、系統(tǒng)總的勢能為縱坐標做出勢能曲線,即可得到增原子擴散的ES勢壘. 以上這個過程是通過什么軟件實現(xiàn)的呢 不甚感激！ |
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