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houzile0金蟲 (小有名氣)
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[求助]
分子靜力學(xué)計算
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哪位大神有分子靜力學(xué)計算的資料啊，分子靜力學(xué)計算是用什么軟件呢，和分子動力學(xué)有什么區(qū)別呢 ES勢壘的靜力學(xué)計算 我們首先對整個晶胞做弛豫,給出初始的穩(wěn)定晶胞,然后把增原子放在臺階，上.靜力學(xué)模擬中,晶胞原子都是自由的;對于增原子,我們在起點(diǎn)(臺階邊緣)和終點(diǎn)之間,沿著擴(kuò)散路徑(x方向)畫一條直線;從起點(diǎn)開始,每隔0.1ax取一個點(diǎn).使增原子在每一點(diǎn)處的x坐標(biāo)固定(這個坐標(biāo)就是反應(yīng)路徑),而垂直于擴(kuò)散路徑的兩個坐標(biāo)(y,z坐標(biāo))則可以自由變化.這樣通過MD模擬,可以得到每一個垂直于反應(yīng)路徑的平面上的系統(tǒng)的勢能最小值(即系統(tǒng)的結(jié)合能).我們以反應(yīng)路徑為橫坐標(biāo)、系統(tǒng)總的勢能為縱坐標(biāo)做出勢能曲線,即可得到增原子擴(kuò)散的ES勢壘. 以上這個過程是通過什么軟件實(shí)現(xiàn)的呢 不甚感激！ |
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houzile0
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