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junjun0711新蟲 (小有名氣)
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[求助]
求助，我想把KEGG中的通路導(dǎo)入cytocape中，請會的前輩指教啊 已有1人參與
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我想把KEGG通路導(dǎo)入cytoscape中，看看我們研究的一些靶點蛋白在通路中的一些情況，不知道怎么能畫出這樣的通路圖~~請教相關(guān)生物信息學(xué)的前輩 。 |
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stoneprince1979
木蟲 (小有名氣)
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【答案】應(yīng)助回帖
| 看到您很早前發(fā)的帖子，不知道您現(xiàn)在用的是哪個版本的，目前cytoscape 3.2.1版本的直接有個app，其下拉菜單中有app manager，點擊后會出現(xiàn)一個菜單，中間有些模塊可以在線安裝，點擊kegg就可以下載安裝到cytoscape中去了，當(dāng)安裝成功后，在軟件的左邊區(qū)域有個cytokegg按鈕，點擊后會發(fā)現(xiàn)有browser pathway，點擊這個按鈕后會有另一個菜單提示你需要的，一般包括：種屬、信號通路名稱，點擊加載就可以再視圖區(qū)域看到了。希望有用！ |
2樓2015-08-27 22:16:52
wuer413023
至尊木蟲 (文壇精英)
沒事領(lǐng)金幣
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3樓2015-08-29 13:46:30
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