 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 查看: 4444 | 回復(fù): 22 | |||||
46437772木蟲 (小有名氣)
|
[交流]
【原創(chuàng)】如何利用KEGG定位基因?qū)儆谀膫�(gè)代謝通路 已有14人參與
|
||||
|
有一些基因，打算確定他們分別和哪些代謝通路相關(guān)，想從KEGG里定位，請(qǐng)問有高手知道如何實(shí)現(xiàn)么？ 我把我摸索的提供一下，可能看起來很簡單，但是對(duì)于從來不知道的（比如以前的我）朋友，找起來可能有點(diǎn)小麻煩  以Human的個(gè)別基因?yàn)槔?/font> 首先打開網(wǎng)址：http://www.genome.jp/kegg/tool/color_pathway.html，  圖中標(biāo)示了紅色1，2，3，為我們操作的地方！ 其中，1是下拉菜單，選擇感興趣的物種，默認(rèn)是Reference Pathway，我選擇Homo sapiens(Human)為例；2是輸入感興趣基因的地方，當(dāng)然修改好格式的文檔也可以直接上傳，文本文檔可以支持，其他的沒試過。3是執(zhí)行按鈕。 此處，需要說明一下：fgcolor為前景顏色（個(gè)人理解），默認(rèn)即可，無需關(guān)注；bgcolor為背景顏色，將來會(huì)在代謝通路中以此顏色突出顯示你關(guān)注的基因，所以建議設(shè)置一下，我的示例數(shù)據(jù)如下圖：  點(diǎn)擊第一張圖中的3，即Exec，應(yīng)該出來下面的結(jié)果：  下面各位就可以點(diǎn)擊相關(guān)的pathway看看你的基因位置啦 發(fā)這樣的帖子挺費(fèi)勁兒啊，第一次還搞錯(cuò)了，圖片又重新上傳編輯的！ 所以在此對(duì)曾經(jīng)發(fā)帖的朋友表示一下敬佩和感謝！ 希望和感興趣的朋友多多交流！ [ Last edited by 46437772 on 2010-12-15 at 22:01 ] |
回復(fù)此樓» 收錄本帖的淘帖專輯推薦
 bioinfomatics | 零碎集 |
» 本帖已獲得的紅花（最新10朵）
fengxiao01» 猜你喜歡
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)中的趣事：實(shí)驗(yàn)器材的 “烏龍”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)中的趣事：和實(shí)驗(yàn)材料的 “斗智斗勇”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
化學(xué)工程及工業(yè)化學(xué)論文潤色/翻譯怎么收費(fèi)?
已經(jīng)有255人回復(fù)
-
蛋白質(zhì)檢測(cè)：精準(zhǔn)分析，解鎖生物分子的密碼
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)之小鼠實(shí)驗(yàn)：嚴(yán)謹(jǐn)設(shè)計(jì)，解析生命機(jī)制的重要載體
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)之重金屬檢測(cè)：精準(zhǔn)篩查，守護(hù)健康與環(huán)境的防線
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)之“蛙測(cè)重金屬我背鍋三千”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)之“鼠逃三次我發(fā)三篇SCI”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
納米粒度分析
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
林科院林化所招收材料與化工專業(yè)碩士，坐標(biāo)南京
已經(jīng)有0人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- 微生物發(fā)酵，代謝產(chǎn)物提取的簡單實(shí)用的方法。
已經(jīng)有50人回復(fù)
- 轉(zhuǎn)基因植物安全嗎？
已經(jīng)有12人回復(fù)
- 枯草芽孢桿菌聚谷氨酸降解酶基因的原核表達(dá)及酶性質(zhì)分析
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 地衣芽孢桿菌的基因敲除到底如何做��？
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 關(guān)于藥物體外二相代謝研究
已經(jīng)有12人回復(fù)
- 如何P一個(gè)全長基因？
已經(jīng)有13人回復(fù)
- 酵母代謝甘油產(chǎn)什么？
已經(jīng)有9人回復(fù)
- RNA樣品中的未除盡基因組DNA
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 研究細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路，建立細(xì)胞系，是否一定要敲出細(xì)胞內(nèi)源性蛋白分子？
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 人體基因?qū)W
已經(jīng)有18人回復(fù)
- 除了利用同源性做PCR外，如何定向篩選一個(gè)基因？
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 在NCBI中查到一個(gè)基因怎么看操縱子和啟動(dòng)子區(qū)域？
已經(jīng)有20人回復(fù)
- 求助關(guān)于基因芯片技術(shù)
已經(jīng)有4人回復(fù)
46437772
木蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 2000.9
- 帖子: 211
- 在線: 52.3小時(shí)
- 蟲號(hào): 577528
- 注冊(cè): 2008-06-27
- 性別: GG
- 專業(yè): MB&BC
3樓2010-12-15 16:17:53
蟲子739
鐵蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 49
- 散金: 2
- 帖子: 119
- 在線: 39.9小時(shí)
- 蟲號(hào): 545129
- 注冊(cè): 2008-04-13
- 專業(yè): 植物進(jìn)化生物學(xué)
7樓2011-03-09 22:51:26
46437772
木蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 2000.9
- 帖子: 211
- 在線: 52.3小時(shí)
- 蟲號(hào): 577528
- 注冊(cè): 2008-06-27
- 性別: GG
- 專業(yè): MB&BC
9樓2011-03-10 17:09:42
scelab
榮譽(yù)版主 (文壇精英)
小木蟲之有關(guān)部門負(fù)責(zé)人
- 應(yīng)助: 63 (初中生)
- 貴賓: 1.475
- 金幣: 8294.6
- 散金: 4158
- 紅花: 39
- 沙發(fā): 99
- 帖子: 21277
- 在線: 3169.3小時(shí)
- 蟲號(hào): 482065
- 注冊(cè): 2007-12-20
- 性別: GG
- 專業(yè): 環(huán)境微生物學(xué)
- 管轄: 微生物
2樓2010-12-15 16:04:11
46437772
木蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 2000.9
- 帖子: 211
- 在線: 52.3小時(shí)
- 蟲號(hào): 577528
- 注冊(cè): 2008-06-27
- 性別: GG
- 專業(yè): MB&BC
搞了半天還是沉了 唉。。。 4樓2010-12-15 22:02:26
haitian0625
金蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 7 (幼兒園)
- 金幣: 1392.4
- 帖子: 123
- 在線: 56.9小時(shí)
- 蟲號(hào): 903890
- 注冊(cè): 2009-11-15
- 性別: GG
- 專業(yè): 基因表達(dá)調(diào)控與表觀遺傳學(xué)
5樓2010-12-16 10:17:59
46437772
木蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 2000.9
- 帖子: 211
- 在線: 52.3小時(shí)
- 蟲號(hào): 577528
- 注冊(cè): 2008-06-27
- 性別: GG
- 專業(yè): MB&BC
6樓2010-12-16 10:19:07
蟲子739
鐵蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 49
- 散金: 2
- 帖子: 119
- 在線: 39.9小時(shí)
- 蟲號(hào): 545129
- 注冊(cè): 2008-04-13
- 專業(yè): 植物進(jìn)化生物學(xué)
8樓2011-03-10 12:14:32
ailunwen
銅蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 116
- 帖子: 38
- 在線: 28小時(shí)
- 蟲號(hào): 904774
- 注冊(cè): 2009-11-16
- 性別: GG
- 專業(yè): 基因表達(dá)調(diào)控與表觀遺傳學(xué)
10樓2011-06-30 08:38:09
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 46437772 的主題更新
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 085410人工智能專碩317求調(diào)劑（0854都可以） +4 | xbxudjdn 2026-03-18 | 4/200 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考博] 東華理工大學(xué)化材專業(yè)26屆碩士博士申請(qǐng) +8 | zlingli 2026-03-13 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 材料考研調(diào)劑 +3 | xwt。 2026-03-19 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué) 305求調(diào)劑 +4 | FY_yy 2026-03-14 | 4/200 |
|
|
[考研] 354求調(diào)劑 +4 | Tyoumou 2026-03-18 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 材料專業(yè)求調(diào)劑 +5 | hanamiko 2026-03-18 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 311求調(diào)劑 +11 | 冬十三 2026-03-15 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 材料專碩306英一數(shù)二 +10 | z1z2z3879 2026-03-16 | 13/650 |
|
|
|
[考研] 材料，紡織，生物（0856、0710），化學(xué)招生啦 +3 | Eember. 2026-03-17 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 生物學(xué)071000 329分求調(diào)劑 +3 | 我愛生物生物愛?/a> 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)336分求調(diào)劑 +6 | zbzihdhd 2026-03-15 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 環(huán)境工程調(diào)劑 +8 | 大可digkids 2026-03-16 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 278求調(diào)劑 +5 | 煙火先于春 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[碩博家園] 湖北工業(yè)大學(xué) 生命科學(xué)與健康學(xué)院-課題組招收2026級(jí)食品/生物方向碩士 +3 | 1喜春8 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 材料專碩326求調(diào)劑 +6 | 墨煜姒莘 2026-03-15 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 一志愿南京大學(xué)，080500材料科學(xué)與工程，調(diào)劑 +4 | Jy? 2026-03-16 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 0854控制工程 359求調(diào)劑 可跨專業(yè) +3 | 626776879 2026-03-14 | 9/450 |
|
|
|
[基金申請(qǐng)]
今年的國基金是打分制嗎？
 50+3
|
zhanghaozhu 2026-03-14 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 本科南京大學(xué)一志愿川大藥學(xué)327 +3 | 麥田耕者 2026-03-14 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 266求調(diào)劑 +4 | 學(xué)員97LZgn 2026-03-13 | 4/200 |
|