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46437772木蟲 (小有名氣)
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[交流]
【原創(chuàng)】如何利用KEGG定位基因屬于哪個代謝通路 已有14人參與
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有一些基因，打算確定他們分別和哪些代謝通路相關，想從KEGG里定位，請問有高手知道如何實現(xiàn)么？ 我把我摸索的提供一下，可能看起來很簡單，但是對于從來不知道的（比如以前的我）朋友，找起來可能有點小麻煩  以Human的個別基因為例！ 首先打開網(wǎng)址：http://www.genome.jp/kegg/tool/color_pathway.html，  圖中標示了紅色1，2，3，為我們操作的地方！ 其中，1是下拉菜單，選擇感興趣的物種，默認是Reference Pathway，我選擇Homo sapiens(Human)為例；2是輸入感興趣基因的地方，當然修改好格式的文檔也可以直接上傳，文本文檔可以支持，其他的沒試過。3是執(zhí)行按鈕。 此處，需要說明一下：fgcolor為前景顏色（個人理解），默認即可，無需關注；bgcolor為背景顏色，將來會在代謝通路中以此顏色突出顯示你關注的基因，所以建議設置一下，我的示例數(shù)據(jù)如下圖：  點擊第一張圖中的3，即Exec，應該出來下面的結果：  下面各位就可以點擊相關的pathway看看你的基因位置啦 發(fā)這樣的帖子挺費勁兒啊，第一次還搞錯了，圖片又重新上傳編輯的！ 所以在此對曾經(jīng)發(fā)帖的朋友表示一下敬佩和感謝！ 希望和感興趣的朋友多多交流！ [ Last edited by 46437772 on 2010-12-15 at 22:01 ] |
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9樓2011-03-10 17:09:42
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2樓2010-12-15 16:04:11
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搞了半天還是沉了 唉。。。 4樓2010-12-15 22:02:26
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