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junjun0711新蟲 (小有名氣)
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[求助]
求助，我想把KEGG中的通路導(dǎo)入cytocape中，請(qǐng)會(huì)的前輩指教啊 已有1人參與
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我想把KEGG通路導(dǎo)入cytoscape中，看看我們研究的一些靶點(diǎn)蛋白在通路中的一些情況，不知道怎么能畫出這樣的通路圖~~請(qǐng)教相關(guān)生物信息學(xué)的前輩 。 |
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stoneprince1979
木蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 5 (幼兒園)
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- 專業(yè): 胰腺外分泌功能異常與胰腺
【答案】應(yīng)助回帖
| 看到您很早前發(fā)的帖子，不知道您現(xiàn)在用的是哪個(gè)版本的，目前cytoscape 3.2.1版本的直接有個(gè)app，其下拉菜單中有app manager，點(diǎn)擊后會(huì)出現(xiàn)一個(gè)菜單，中間有些模塊可以在線安裝，點(diǎn)擊kegg就可以下載安裝到cytoscape中去了，當(dāng)安裝成功后，在軟件的左邊區(qū)域有個(gè)cytokegg按鈕，點(diǎn)擊后會(huì)發(fā)現(xiàn)有browser pathway，點(diǎn)擊這個(gè)按鈕后會(huì)有另一個(gè)菜單提示你需要的，一般包括：種屬、信號(hào)通路名稱，點(diǎn)擊加載就可以再視圖區(qū)域看到了。希望有用！ |
2樓2015-08-27 22:16:52
wuer413023
至尊木蟲 (文壇精英)
沒事領(lǐng)金幣
- 應(yīng)助: 3 (幼兒園)
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3樓2015-08-29 13:46:30
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