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[求助]
季銨鹽分子的建模問題 已有1人參與
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分子動力學(xué)模擬小白，想畫一個有機(jī)季銨鹽的分子結(jié)構(gòu)（陰離子是氯離子），主要的部分都搞定了。 關(guān)鍵的氮原子和氯原子不知道怎么辦，也用一根bond連接起來嗎？ 電荷怎么辦？怎么表示離子鍵呢？ 急求�。�！ |
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月只藍(lán): 金幣+1, 鼓勵交流！ 2014-04-01 08:34:09
月只藍(lán): 金幣+1, 鼓勵交流！ 2014-04-01 08:34:09
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感謝應(yīng)助。 我做的是生物大分子與小分子的相互作用。小分子的建模時，我想把季銨鹽的結(jié)構(gòu)畫出來�？吹桨嫔嫌懻摰男薷牡宇愋秃碗姾傻姆椒�，我照著做了一下，修改了total charge和formal charge，但是minimizer和dynamics之后電荷有發(fā)生了變化。 我也分別試了有氯離子和沒有氯離子的情況，有氯離子時total charge設(shè)的是0，但是minimizer和dynamics之后電荷同樣發(fā)生了變化。 我是試著做的，現(xiàn)在是不知道哪里對，也不知道哪里不對。請大神指導(dǎo)��！ |
3樓2014-03-31 22:36:10
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2樓2014-03-31 21:39:52
月只藍(lán)
主管區(qū)長 (職業(yè)作家)
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4樓2014-04-01 08:40:00
5樓2014-04-01 08:59:29
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