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yichen0405

銅蟲(chóng) (小有名氣)

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[求助] 怎么計(jì)算含有特定堿基序列的基因的含量已有1人參與

堿基序列很短，到底怎么做呢？求助大神啊

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1樓 2014-04-14 10:19:35

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liuderong

鐵桿木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)

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【答案】應(yīng)助回帖

引用回帖:

3樓: Originally posted by yichen0405 at 2014-04-14 17:22:18
目標(biāo)基因是含有我的特定堿基序列的基因嗎？你說(shuō)的計(jì)算機(jī)代碼完成匹配，我確實(shí)不會(huì)啊。不知道你那有沒(méi)有相關(guān)的文獻(xiàn)，告訴我啊...

以前老師叫我找過(guò)一些這樣的基因。她先把擬南芥所有的基因給我，然后再給出一段序列，要求從擬南芥基因中找出所有含有那段制定序列的基因。不知道你要找的是不是這樣，要是類(lèi)似我可以幫你找找。

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4樓2014-04-14 18:06:59

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liuderong

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【答案】應(yīng)助回帖

感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1

你說(shuō)的“含量”應(yīng)該是一個(gè)比例吧，要算這個(gè)比例就先把所有的目標(biāo)基因都下載好，然后用你的堿基序列去匹配。要寫(xiě)一個(gè)計(jì)算機(jī)代碼才能完成所有匹配。

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2樓2014-04-14 12:59:19

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2樓: Originally posted by liuderong at 2014-04-14 12:59:19
你說(shuō)的“含量”應(yīng)該是一個(gè)比例吧，要算這個(gè)比例就先把所有的目標(biāo)基因都下載好，然后用你的堿基序列去匹配。要寫(xiě)一個(gè)計(jì)算機(jī)代碼才能完成所有匹配。

目標(biāo)基因是含有我的特定堿基序列的基因嗎？你說(shuō)的計(jì)算機(jī)代碼完成匹配，我確實(shí)不會(huì)啊。不知道你那有沒(méi)有相關(guān)的文獻(xiàn)，告訴我啊

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3樓2014-04-14 17:22:18

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4樓: Originally posted by liuderong at 2014-04-14 18:06:59
以前老師叫我找過(guò)一些這樣的基因。她先把擬南芥所有的基因給我，然后再給出一段序列，要求從擬南芥基因中找出所有含有那段制定序列的基因。不知道你要找的是不是這樣，要是類(lèi)似我可以幫你找找。...

那你是怎么做的啊?我現(xiàn)在只知道在NCBI上查，而且還不怎么會(huì)用。老師讓我在人類(lèi)基因組里找到含有特定序列的基因，還要知道含量，好難啊

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5樓2014-04-16 10:43:04

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