 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 816 | 回復(fù): 4 | ||
keke_1210木蟲(chóng) (小有名氣)
|
[求助]
Autodock三體對(duì)接
|
|
我現(xiàn)在做的是蛋白酶抑制劑的動(dòng)力學(xué)模擬研究。抑制劑與該酶的輔酶因子競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合該酶�，F(xiàn)在已經(jīng)做了抑制劑與該酶的分子動(dòng)力學(xué)模擬，知道其機(jī)理，想進(jìn)一步確定下輔酶因子的非競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合的作用能，與抑制劑進(jìn)行比較。 想將輔酶因子對(duì)接到抑制劑與該酶的復(fù)合物，然后進(jìn)行一段時(shí)間的MD，這個(gè)是做半柔性對(duì)接好呢，還是剛性對(duì)接好呢？半柔性對(duì)接的話需要限制哪些鍵或殘基不旋轉(zhuǎn)？這個(gè)半柔性對(duì)接對(duì)于輔酶因子不知道符不符合生物上的機(jī)理？ 現(xiàn)在用的對(duì)接軟件是AUTODOCK4.0，有沒(méi)有更好地建議？ |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
材料求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
354求調(diào)劑
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
化學(xué)工程321分求調(diào)劑
已經(jīng)有22人回復(fù)
-
考研調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
326求調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
333求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
一志愿東華大學(xué)控制學(xué)碩320求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
考研化學(xué)學(xué)碩調(diào)劑，一志愿985
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
0703化學(xué)調(diào)劑
已經(jīng)有15人回復(fù)
-
0703化學(xué)調(diào)劑 ，六級(jí)已過(guò)，有科研經(jīng)歷
已經(jīng)有14人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- autodock對(duì)接的氫鍵
已經(jīng)有7人回復(fù)
- Autodock的dlg文件有沒(méi)有好的分析軟件，一個(gè)一個(gè)另存導(dǎo)入到Pymol太慢了
已經(jīng)有3人回復(fù)
- autodock柔性對(duì)接
已經(jīng)有5人回復(fù)
- Autodock對(duì)接構(gòu)象準(zhǔn)確性的評(píng)價(jià)——RMSD
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 用autodock對(duì)接，用什么軟件定點(diǎn)突變蛋白質(zhì)
已經(jīng)有14人回復(fù)
- linux下的autodock在run autodock時(shí)不出現(xiàn)dlg文件
已經(jīng)有8人回復(fù)
- autodock對(duì)接時(shí)蛋白的處理問(wèn)題
已經(jīng)有6人回復(fù)
- Autodock中受體的準(zhǔn)備
已經(jīng)有14人回復(fù)
- 有關(guān)Autodock結(jié)果分析中結(jié)合自由能的問(wèn)題
已經(jīng)有6人回復(fù)
- autodock的安裝
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 用autodock做對(duì)接，box設(shè)置無(wú)法包括受體活性區(qū)域和配體
已經(jīng)有6人回復(fù)
- AUTODOCK對(duì)接步驟求助(附圖）
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 用AutoDock作分子對(duì)接前的小分子能量最小化問(wèn)題
已經(jīng)有6人回復(fù)
- AutoDock的安裝？
已經(jīng)有7人回復(fù)
- Autodock對(duì)接構(gòu)象有問(wèn)題，請(qǐng)教
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 【求助】請(qǐng)教Autodock結(jié)果分析
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 【求助】autodock4 安裝問(wèn)題
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 【求助】高手求助,Autodock4 最后一步無(wú)法對(duì)接,弄了幾天!
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 【求助】求助：怎樣將Autodock做出來(lái)的對(duì)接圖保存成pdb格式？謝謝
已經(jīng)有12人回復(fù)
- 【原創(chuàng)】AutoDock使用筆記總結(jié)－原創(chuàng)始發(fā)
已經(jīng)有32人回復(fù)
keke_1210
木蟲(chóng) (小有名氣)
- 應(yīng)助: 3 (幼兒園)
- 金幣: 3050.7
- 紅花: 1
- 帖子: 122
- 在線: 123.7小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1999637
- 注冊(cè): 2012-09-14
- 性別: MM
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
2樓2014-04-14 17:15:09
老曼7
鐵桿木蟲(chóng) (正式寫手)
- 應(yīng)助: 6 (幼兒園)
- 金幣: 5876.9
- 散金: 227
- 紅花: 4
- 帖子: 506
- 在線: 109.5小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1941783
- 注冊(cè): 2012-08-16
- 性別: GG
- 專業(yè): 藥物設(shè)計(jì)與藥物信息
3樓2016-01-29 14:56:52
keke_1210
木蟲(chóng) (小有名氣)
- 應(yīng)助: 3 (幼兒園)
- 金幣: 3050.7
- 紅花: 1
- 帖子: 122
- 在線: 123.7小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1999637
- 注冊(cè): 2012-09-14
- 性別: MM
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
4樓2016-01-29 15:35:35
老曼7
鐵桿木蟲(chóng) (正式寫手)
- 應(yīng)助: 6 (幼兒園)
- 金幣: 5876.9
- 散金: 227
- 紅花: 4
- 帖子: 506
- 在線: 109.5小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 1941783
- 注冊(cè): 2012-08-16
- 性別: GG
- 專業(yè): 藥物設(shè)計(jì)與藥物信息
|
這個(gè)似乎沒(méi)有一個(gè)比較準(zhǔn)確的說(shuō)法，都是免費(fèi)的，我覺(jué)得你可以自己拿自己的幾個(gè)體系測(cè)試一下，哪個(gè)好一點(diǎn)就用哪個(gè)咯 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端 |
5樓2016-01-29 19:24:19
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 keke_1210 的主題更新
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 311求調(diào)劑 +7 | 26研0 2026-03-15 | 7/350 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 297求調(diào)劑 +3 | 喜歡還是不甘心 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 299求調(diào)劑 +5 | shxchem 2026-03-20 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 0805材料320求調(diào)劑 +3 | 深海物語(yǔ) 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿西安交通大學(xué)材料工程專業(yè) 282分求調(diào)劑 +8 | 楓橋ZL 2026-03-18 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 279分求調(diào)劑 一志愿211 +14 | chaojifeixia 2026-03-19 | 15/750 |
|
|
|
[考研] 332求調(diào)劑 +3 | 鳳凰院丁真 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 初始318分求調(diào)劑（有工作經(jīng)驗(yàn)） +3 | 1911236844 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +6 | 曼殊2266 2026-03-18 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 294求調(diào)劑材料與化工專碩 +15 | 陌の森林 2026-03-18 | 15/750 |
|
|
|
[考研] 一志愿中海洋材料工程專碩330分求調(diào)劑 +8 | 小材化本科 2026-03-18 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 一志愿 西北大學(xué) ，070300化學(xué)學(xué)碩，總分287，雙非一本，求調(diào)劑。 +4 | 晨昏線與星海 2026-03-19 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 北科281學(xué)碩材料求調(diào)劑 +5 | tcxiaoxx 2026-03-20 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿吉林大學(xué)材料學(xué)碩321求調(diào)劑 +11 | Ymlll 2026-03-18 | 15/750 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +3 | eation27 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 334求調(diào)劑 +3 | 志存高遠(yuǎn)意在機(jī)?/a> 2026-03-16 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 326求調(diào)劑 +5 | 上岸的小葡 2026-03-15 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 275求調(diào)劑 +4 | 太陽(yáng)花天天開(kāi)心 2026-03-16 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 考研調(diào)劑 +3 | 淇ya_~ 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 0856求調(diào)劑 +3 | 劉夢(mèng)微 2026-03-15 | 3/150 |
|