shangshui123

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[求助] DMOL3求吸附能遇到問題已有2人參與

最近在計算4原子銅簇A與有機大分子B（約100個原子），大分子上含苯環(huán)、碳氫氧元素，再求銅簇與苯環(huán)上吸附時，發(fā)現(xiàn)吸附能過大約3ev，后來在高手指導下我把簇模型和大分子放開有幾十個埃米左右再優(yōu)化，發(fā)現(xiàn)能量值并不等于之前銅簇和大分子的能量和，前后相差1.6ev.從理論上講應(yīng)該是相等的啊，因為沒有相互作用嗎。后來我把他們簇模型和大分子整體固定住，優(yōu)化后發(fā)現(xiàn)能量基本沒有變化,和不固定時能量基本相等。想問問哪位大神遇到過此種問題，怎么解決的，謝謝。
另外，我算過兩個同簇模型放在一塊但是相距很遠，優(yōu)化后能量是原來單個簇的能量的兩倍，且把同樣的兩個大分子放在一起但是相聚很遠優(yōu)化后，能量是單個分子的兩倍。
我的參數(shù)如下：Spin_polarization          unrestricted
Charge                      0
Basis                      dnp
Pseudopotential             dspp
Functional                   gga(p91)
Aux_density                octupole
Integration_grid             medium
Occupation                   thermal 0.0050
Cutoff_Global                4.0000 angstrom
Scf_density_convergence    1.0000e-005
Scf_charge_mixing          0.2000
Scf_spin_mixing             0.5000
Scf_iterations             999
Scf_diis                   6 pulay

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1樓 2014-04-27 20:49:55

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mywai520

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【答案】應(yīng)助回帖

感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1

放開幾十A那還是一樣的結(jié)構(gòu)，都不在一個體系，怎么能一樣。可能是我理解錯了，能不能講清楚些！�。。。�

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2樓2014-04-27 22:20:35

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2樓: Originally posted by mywai520 at 2014-04-27 22:20:35
放開幾十A那還是一樣的結(jié)構(gòu)，都不在一個體系，怎么能一樣�？赡苁俏依斫忮e了，能不能講清楚些�。。。�！

放開幾十個A是想讓他們沒有作用，在一個體系中的，DMOL是無限延伸的，放進的話，比如十個A，結(jié)果也是一樣的，我沒有建板模型，因此是在一個體系中的

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3樓2014-04-27 22:30:39

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3樓: Originally posted by shangshui123 at 2014-04-27 22:30:39
放開幾十個A是想讓他們沒有作用，在一個體系中的，DMOL是無限延伸的，放進的話，比如十個A，結(jié)果也是一樣的，我沒有建板模型，因此是在一個體系中的...

你放在一起的時候，他們都成鍵了。成鍵要放去能量，或者比較近的情況下有范德瓦爾斯力作用，這些都會影響體系。

你放那么遠，就是兩個沒有干涉的體系。這怎么能說是同一體系？？？？？

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4樓2014-04-27 22:35:36

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不知道你的所謂理論上應(yīng)該如此，這是什么理論？若是有根據(jù)，我想看看。

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5樓2014-04-27 22:36:21

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5樓: Originally posted by mywai520 at 2014-04-27 22:36:21
不知道你的所謂理論上應(yīng)該如此，這是什么理論？若是有根據(jù)，我想看看。

我放在十個埃米的距離時，也是這樣的結(jié)果，相差-1.6ev，即便有范德華力，也不可能這么大吧。我的理論是基于化學常識，因為他們相距很遠，所以之間不應(yīng)該有那么大的力。我之所以這么做，是因為之前計算我的吸附能達到-3ev，一直找不出原因，所以我才這么做的。

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6樓2014-04-28 08:37:47

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6樓: Originally posted by shangshui123 at 2014-04-28 08:37:47
我放在十個埃米的距離時，也是這樣的結(jié)果，相差-1.6ev，即便有范德華力，也不可能這么大吧。我的理論是基于化學常識，因為他們相距很遠，所以之間不應(yīng)該有那么大的力。我之所以這么做，是因為之前計算我的吸附能達 ...

你前面的說法是這兩個要相等，這不可能。你放在了一起，相互作用了，總能肯定要降低。這沒有任何問題

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7樓2014-04-28 08:56:37

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5樓: Originally posted by mywai520 at 2014-04-27 22:36:21
不知道你的所謂理論上應(yīng)該如此，這是什么理論？若是有根據(jù)，我想看看。

另外我把它們都固定住，在十個埃米左右的距離時，也不是相等的。我就覺得很奇怪，不該是這樣的呀。

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8樓2014-04-28 08:57:20

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8樓: Originally posted by shangshui123 at 2014-04-28 08:57:20
另外我把它們都固定住，在十個埃米左右的距離時，也不是相等的。我就覺得很奇怪，不該是這樣的呀。...

重新說一下，你是不是認為放在一起跟放在很遠固定，這兩種情況能量要相等？
若是這樣，那你的想法就錯了，這不可能相等。

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9樓2014-04-28 09:02:42

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9樓: Originally posted by mywai520 at 2014-04-28 09:02:42
重新說一下，你是不是認為放在一起跟放在很遠固定，這兩種情況能量要相等？
若是這樣，那你的想法就錯了，這不可能相等。...

是這個意思，為啥不會相等嗎

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10樓2014-04-28 09:54:24

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