 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 7430 | 回復(fù): 8 | |||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話題的所有回帖 | |||
[交流]
Primer5里面的false priming令人困惑不已 已有5人參與
|
|||
|
用Primer5設(shè)計(jì)上下游引物的時候，感覺下游引物不太合適就編輯了一下，哪知編輯過后，false priming欄目里就出現(xiàn)了一個Most stable dimer，可我仔細(xì)瞅了瞅，這個dimer不就是下游引物和我的模板鏈結(jié)合在一起的嗎，這怎么算是false呢？而且顯示其Delta G是-44kcal/mol，我個人感覺Primer5對該引物false priming的判斷是錯誤的，大家覺得呢？ 另外，打開“All”后，還發(fā)現(xiàn)了另一個false priming dimer，也就是我編輯過后的引物和模板鏈其他部位的堿基對應(yīng)堿基相連接起來了，我就不明白了，我只是把之前的那個下游引物的5’端和3’端各刪了一個堿基，難道在我沒刪那兩堿基之前，原本的那個下游引物就不能和模板鏈的相關(guān)部位的堿基連接起來嗎？ 感覺Primer5有許多地方讓我困惑，之前用其設(shè)計(jì)了一對引物，他們的cross dimer的Delta G是-5.4kcal/mol，而用oligo7檢測了后，mixed oligos的Delta G是-2.5kcal/mol，而且兩個軟件所生成的the most stable dimer的形式都不一樣。 軟件一只是用來預(yù)測的，其正確性一定不是100%，但是Primer5的false priming一欄讓我太過困惑，還希望戰(zhàn)友們不吝賜教，相互交流，不斷進(jìn)步！ 謝過！ |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)中的趣事：實(shí)驗(yàn)器材的 “烏龍”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)中的趣事：和實(shí)驗(yàn)材料的 “斗智斗勇”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
化學(xué)工程及工業(yè)化學(xué)論文潤色/翻譯怎么收費(fèi)?
已經(jīng)有124人回復(fù)
-
蛋白質(zhì)檢測：精準(zhǔn)分析，解鎖生物分子的密碼
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)之小鼠實(shí)驗(yàn)：嚴(yán)謹(jǐn)設(shè)計(jì)，解析生命機(jī)制的重要載體
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)之重金屬檢測：精準(zhǔn)篩查，守護(hù)健康與環(huán)境的防線
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)之“蛙測重金屬我背鍋三千”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)之“鼠逃三次我發(fā)三篇SCI”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
納米粒度分析
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
林科院林化所招收材料與化工專業(yè)碩士，坐標(biāo)南京
已經(jīng)有0人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 一段序列設(shè)計(jì)的同一個引物在Primer Premier5.0和Oligo 6.0分析結(jié)果不一樣
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 急！基因用PRIMER5翻譯出來為什么和密碼子不符？
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 求助Primer premier 5.0安裝后內(nèi)存不能為read問題
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 【分享】dnaman和primer5中文使用手冊【已搜索無重復(fù)】
已經(jīng)有15人回復(fù)
我家葉子
新蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 1131.6
- 散金: 107
- 紅花: 3
- 帖子: 751
- 在線: 78.7小時
- 蟲號: 7005568
- 注冊: 2017-07-29
- 專業(yè): 拓?fù)鋵W(xué)
8樓2018-07-02 18:43:36
快樂農(nóng)夫
木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 16 (小學(xué)生)
- 金幣: 3225.6
- 散金: 200
- 紅花: 7
- 帖子: 859
- 在線: 240.9小時
- 蟲號: 2379017
- 注冊: 2013-03-26
- 性別: GG
- 專業(yè): 觀賞園藝學(xué)
2樓2014-05-12 20:01:44
3樓2014-05-12 20:10:24
mojx
金蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 2 (幼兒園)
- 金幣: 1402.4
- 散金: 105
- 紅花: 3
- 帖子: 516
- 在線: 236.9小時
- 蟲號: 2083867
- 注冊: 2012-10-24
- 性別: GG
- 專業(yè): 林木遺傳育種學(xué)
4樓2014-05-16 20:25:39
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 0856調(diào)劑，是學(xué)校就去 +4 | sllhht 2026-03-19 | 5/250 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 【考研調(diào)劑】化學(xué)專業(yè) 281分，一志愿四川大學(xué)，誠心求調(diào)劑 +5 | 吃吃吃才有意義 2026-03-19 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +3 | Mqqqqqq 2026-03-19 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 +5 | pupcoco 2026-03-17 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 085600材料與化工求調(diào)劑 +6 | 緒幸與子 2026-03-17 | 6/300 |
|
|
[考研] 一志愿華中科技大學(xué)，080502，354分求調(diào)劑 +4 | 守候夕陽CF 2026-03-18 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 085600材料與化工 +5 | 安全上岸！ 2026-03-16 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 299求調(diào)劑 +5 | △小透明* 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考博] 26博士申請 +3 | 1042136743 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 考研求調(diào)劑 +3 | 橘頌. 2026-03-17 | 4/200 |
|
|
|
[碩博家園] 湖北工業(yè)大學(xué) 生命科學(xué)與健康學(xué)院-課題組招收2026級食品/生物方向碩士 +3 | 1喜春8 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 材料與化工專碩調(diào)劑 +5 | heming3743 2026-03-16 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿，福州大學(xué)材料專碩339分求調(diào)劑 +3 | 木子momo青爭 2026-03-15 | 3/150 |
|
|
|
[考研] [導(dǎo)師推薦]西南科技大學(xué)國防/材料導(dǎo)師推薦 +3 | 尖角小荷 2026-03-16 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +4 | ahbd 2026-03-14 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿華中師范071000，325求調(diào)劑 +6 | RuitingC 2026-03-12 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 290分有科研經(jīng)歷，論文在投 +7 | 膩膩gk 2026-03-14 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 297一志愿上交085600求調(diào)劑 +5 | 指尖八千里 2026-03-14 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 328求調(diào)劑 +3 | 5201314Lsy！ 2026-03-13 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 295求調(diào)劑 +3 | 小匕仔汁 2026-03-12 | 3/150 |
|