 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 9 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 7425 | 回復: 8 | |||
[交流]
Primer5里面的false priming令人困惑不已 已有5人參與
|
|
用Primer5設(shè)計上下游引物的時候，感覺下游引物不太合適就編輯了一下，哪知編輯過后，false priming欄目里就出現(xiàn)了一個Most stable dimer，可我仔細瞅了瞅，這個dimer不就是下游引物和我的模板鏈結(jié)合在一起的嗎，這怎么算是false呢？而且顯示其Delta G是-44kcal/mol，我個人感覺Primer5對該引物false priming的判斷是錯誤的，大家覺得呢？ 另外，打開“All”后，還發(fā)現(xiàn)了另一個false priming dimer，也就是我編輯過后的引物和模板鏈其他部位的堿基對應(yīng)堿基相連接起來了，我就不明白了，我只是把之前的那個下游引物的5’端和3’端各刪了一個堿基，難道在我沒刪那兩堿基之前，原本的那個下游引物就不能和模板鏈的相關(guān)部位的堿基連接起來嗎？ 感覺Primer5有許多地方讓我困惑，之前用其設(shè)計了一對引物，他們的cross dimer的Delta G是-5.4kcal/mol，而用oligo7檢測了后，mixed oligos的Delta G是-2.5kcal/mol，而且兩個軟件所生成的the most stable dimer的形式都不一樣。 軟件一只是用來預測的，其正確性一定不是100%，但是Primer5的false priming一欄讓我太過困惑，還希望戰(zhàn)友們不吝賜教，相互交流，不斷進步！ 謝過！ |
回復此樓» 猜你喜歡
不合理蛙科研實驗中的趣事：實驗器材的 “烏龍”
已經(jīng)有0人回復
-
不合理蛙科研實驗中的趣事：和實驗材料的 “斗智斗勇”
已經(jīng)有0人回復
-
化學工程及工業(yè)化學論文潤色/翻譯怎么收費?
已經(jīng)有51人回復
-
蛋白質(zhì)檢測：精準分析，解鎖生物分子的密碼
已經(jīng)有0人回復
-
不合理蛙科研實驗之小鼠實驗：嚴謹設(shè)計，解析生命機制的重要載體
已經(jīng)有0人回復
-
不合理蛙科研實驗之重金屬檢測：精準篩查，守護健康與環(huán)境的防線
已經(jīng)有0人回復
-
不合理蛙科研實驗之“蛙測重金屬我背鍋三千”
已經(jīng)有0人回復
-
不合理蛙科研實驗之“鼠逃三次我發(fā)三篇SCI”
已經(jīng)有0人回復
-
納米粒度分析
已經(jīng)有3人回復
-
林科院林化所招收材料與化工專業(yè)碩士，坐標南京
已經(jīng)有0人回復
» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 一段序列設(shè)計的同一個引物在Primer Premier5.0和Oligo 6.0分析結(jié)果不一樣
已經(jīng)有4人回復
- 急！基因用PRIMER5翻譯出來為什么和密碼子不符？
已經(jīng)有4人回復
- 求助Primer premier 5.0安裝后內(nèi)存不能為read問題
已經(jīng)有8人回復
- 【分享】dnaman和primer5中文使用手冊【已搜索無重復】
已經(jīng)有15人回復
快樂農(nóng)夫
木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 16 (小學生)
- 金幣: 3225.6
- 散金: 200
- 紅花: 7
- 帖子: 859
- 在線: 240.9小時
- 蟲號: 2379017
- 注冊: 2013-03-26
- 性別: GG
- 專業(yè): 觀賞園藝學
2樓2014-05-12 20:01:44
3樓2014-05-12 20:10:24
mojx
金蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 2 (幼兒園)
- 金幣: 1402.4
- 散金: 105
- 紅花: 3
- 帖子: 516
- 在線: 236.9小時
- 蟲號: 2083867
- 注冊: 2012-10-24
- 性別: GG
- 專業(yè): 林木遺傳育種學
4樓2014-05-16 20:25:39
witness313
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 8.5
- 帖子: 1
- 在線: 5分鐘
- 蟲號: 3016947
- 注冊: 2014-03-04
- 專業(yè): 動物形態(tài)學及胚胎學
5樓2014-07-03 12:06:43
快樂農(nóng)夫
木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 16 (小學生)
- 金幣: 3225.6
- 散金: 200
- 紅花: 7
- 帖子: 859
- 在線: 240.9小時
- 蟲號: 2379017
- 注冊: 2013-03-26
- 性別: GG
- 專業(yè): 觀賞園藝學
6樓2014-07-04 05:32:25
★
小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
|
本帖內(nèi)容被屏蔽 |
7樓2018-07-01 18:29:46
我家葉子
新蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 1131.6
- 散金: 107
- 紅花: 3
- 帖子: 751
- 在線: 78.7小時
- 蟲號: 7005568
- 注冊: 2017-07-29
- 專業(yè): 拓撲學
8樓2018-07-02 18:43:36
我家葉子
新蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 1131.6
- 散金: 107
- 紅花: 3
- 帖子: 751
- 在線: 78.7小時
- 蟲號: 7005568
- 注冊: 2017-07-29
- 專業(yè): 拓撲學
★ ★
小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
drwhoknowss: 金幣+1, 鼓勵交流 2018-07-03 00:58:54
小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
drwhoknowss: 金幣+1, 鼓勵交流 2018-07-03 00:58:54
|
樓主可以說把問題描述的很清楚了，我之前跟你一樣，估計這塊改了后算法不一樣，覺得改了后看其他項情況是否答標就可以了，還有你說改了后出現(xiàn)非特異性結(jié)合，估計你改動了幾個堿基就滿足了程序算法就顯示出有非特異性結(jié)合位點 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
9樓2018-07-02 18:46:51
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 朱慶平 的主題更新
| 9 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 288求調(diào)劑 +7 | 于海海海海 2026-03-19 | 7/350 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 0817 化學工程 299分求調(diào)劑 有科研經(jīng)歷 有二區(qū)文章 +12 | rare12345 2026-03-18 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 286求調(diào)劑 +6 | lemonzzn 2026-03-16 | 10/500 |
|
|
[考研] 一志愿南昌大學，327分，材料與化工085600 +3 | Ncdx123456 2026-03-19 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿985，本科211，0817化學工程與技術(shù)319求調(diào)劑 +10 | Liwangman 2026-03-15 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 0703化學調(diào)劑 +8 | 妮妮ninicgb 2026-03-15 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 材料專業(yè)求調(diào)劑 +5 | hanamiko 2026-03-18 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 268求調(diào)劑 +7 | 好運連綿不絕 2026-03-12 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 一志愿，福州大學材料專碩339分求調(diào)劑 +3 | 木子momo青爭 2026-03-15 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 321求調(diào)劑 +5 | 大米飯！ 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 085600調(diào)劑 +5 | 漾漾123sun 2026-03-12 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 070303 總分349求調(diào)劑 +3 | LJY9966 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 26考研一志愿中國石油大學(華東)305分求調(diào)劑 +3 | 嘉年新程 2026-03-15 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 288求調(diào)劑 +4 | 奇點0314 2026-03-14 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 本科南京大學一志愿川大藥學327 +3 | 麥田耕者 2026-03-14 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 330求調(diào)劑 +3 | ?醬給調(diào)劑跪了 2026-03-13 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 求材料調(diào)劑 085600英一數(shù)二總分302 前三科235 精通機器學習 一志愿哈工大 +4 | 林yaxin 2026-03-12 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 085600材料與化工 309分請求調(diào)劑 +7 | dtdxzxx 2026-03-12 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 一志愿山大07化學 332分 四六級已過 本科山東雙非 求調(diào)劑！ +3 | 不想理你 2026-03-12 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 321求調(diào)劑（食品/專碩） +3 | mxcz321 2026-03-12 | 6/300 |
|