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zengxianlei鐵蟲(chóng) (初入文壇)
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求解析hzo基因，amoA基因 已有2人參與
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| 我剛做厭氧氨氧化菌菌落多樣性的研究，在查看文獻(xiàn)中發(fā)現(xiàn)有人通過(guò)hzo基因來(lái)做的，也有人通過(guò)amoZ基因來(lái)做的，我們實(shí)驗(yàn)室偏向于通過(guò)16SrDNA來(lái)做。哪路高水能幫我比較一下這三種方案的優(yōu)劣？ |
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采用16S rDNA作為探針，得到的是微生物的種類組成，我們稱之為群落結(jié)構(gòu)。 采用amoA（AOA/AOB）和hzo,得到的序列是這兩個(gè)酶的編碼基因的一部分，反應(yīng)的是代謝途徑的多樣性，我們稱之為功能多樣性。 一般情況下，我們需要將群落結(jié)構(gòu)即微生物多樣性與功能多樣性進(jìn)行比較分析，因?yàn)�，存在這樣的可能，即群落結(jié)構(gòu)相似，但是代謝途徑不同，或者活躍的代謝途徑不同。 主流一點(diǎn)兒的技術(shù)，你應(yīng)該做amoA和hzo在環(huán)境中的rna的豐度和組成分析，得到活躍的功能基因組成與豐度，從而實(shí)現(xiàn)對(duì)不同環(huán)境樣品或者不同環(huán)境處理過(guò)程中，amoA及hzo的活躍程度和響應(yīng)特征。 |
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zengxianlei7樓2014-05-23 16:30:24
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9樓2014-05-23 16:33:54
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