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zengxianlei鐵蟲 (初入文壇)
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[求助]
求解析hzo基因,amoA基因 已有2人參與
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| 我剛做厭氧氨氧化菌菌落多樣性的研究,在查看文獻(xiàn)中發(fā)現(xiàn)有人通過hzo基因來做的,也有人通過amoZ基因來做的,我們實(shí)驗(yàn)室偏向于通過16SrDNA來做。哪路高水能幫我比較一下這三種方案的優(yōu)劣? |
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有機(jī)的微生物大神
鐵蟲 (初入文壇)
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采用16S rDNA作為探針,得到的是微生物的種類組成,我們稱之為群落結(jié)構(gòu)。 采用amoA(AOA/AOB)和hzo,得到的序列是這兩個酶的編碼基因的一部分,反應(yīng)的是代謝途徑的多樣性,我們稱之為功能多樣性。 一般情況下,我們需要將群落結(jié)構(gòu)即微生物多樣性與功能多樣性進(jìn)行比較分析,因?yàn),存在這樣的可能,即群落結(jié)構(gòu)相似,但是代謝途徑不同,或者活躍的代謝途徑不同。 主流一點(diǎn)兒的技術(shù),你應(yīng)該做amoA和hzo在環(huán)境中的rna的豐度和組成分析,得到活躍的功能基因組成與豐度,從而實(shí)現(xiàn)對不同環(huán)境樣品或者不同環(huán)境處理過程中,amoA及hzo的活躍程度和響應(yīng)特征。 |

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