 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 4 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 5135 | 回復(fù): 3 | |||
cenwanglai榮譽(yù)版主 (知名作家)
老和山猥瑣派九段
|
[求助]
經(jīng)典分子動(dòng)力學(xué)截?cái)喟霃皆O(shè)置為多少比較合適？ 已有1人參與
|
|
在DL_POLY中，截?cái)喟霃接袃蓚�(gè)：一個(gè)是總的截?cái)喟霃絚utoff，另外一個(gè)是范德華力截?cái)喟霃絩vdw cutoff. 程序要求rvdw cutoff <=cutoff. 我的問題是，根據(jù)什么原則來設(shè)置cutoff呢？ （1）如果計(jì)算資源無限，原則上，是不是cutoff越大越好？ （2）是不是可以通過一個(gè)系列的測試來確定合理的cutoff: 按照一定間隔設(shè)置5~8個(gè)截?cái)喟霃�，相同狀態(tài)（nPVT)下,看系統(tǒng)平衡后的總能隨截?cái)喟霃降淖兓厔荨?br /> 截?cái)喟霃皆酱�，總能越低，取總能趨于穩(wěn)定的最小截?cái)喟霃健?br /> （3）設(shè)置一套參數(shù)，計(jì)算可以與實(shí)驗(yàn)結(jié)果相比較的性質(zhì)，一次來判定參數(shù)設(shè)置的合理性。但我覺得，應(yīng)該先按照（2）的方式明確截?cái)喟霃降挠绊懸?guī)律，然后才考慮與實(shí)驗(yàn)結(jié)果的對(duì)比驗(yàn)證。因?yàn)椋词古c實(shí)驗(yàn)吻合的再好，但對(duì)其中的物理本質(zhì)和規(guī)律沒有理解到，不能算是好的模擬計(jì)算工作。 (4)具體到簡單氣體分子（5個(gè)原子以下的氣體分子）體系，近常溫常壓下分子之間的距離在15~30埃；如果考慮200*200*300埃的大盒子，截?cái)喟霃揭话阍诙啻蠓秶? |
回復(fù)此樓» 收錄本帖的淘帖專輯推薦
 amber |
» 猜你喜歡
0856材料專碩353求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
山東省面上項(xiàng)目限額評(píng)審
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
一志愿北京化工大學(xué)070300 學(xué)碩336求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
生物學(xué)071000 329分求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
一志愿華中科技大學(xué)071000，求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
生物學(xué)一志愿985，分?jǐn)?shù)349求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
生物學(xué)調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
求調(diào)劑院校信息
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
085600材料與化工306
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
286求調(diào)劑
已經(jīng)有10人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- 分子動(dòng)力學(xué)半徑模擬
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 求助：lammps非周期邊界
已經(jīng)有22人回復(fù)
- 怎么實(shí)現(xiàn)時(shí)間步長不同的兩個(gè)函數(shù)的相關(guān)計(jì)算
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 時(shí)間步長設(shè)置，截?cái)喟霃皆O(shè)置
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 截?cái)嗄?K點(diǎn) 原子數(shù)量 關(guān)系
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 關(guān)于MS做分子動(dòng)力學(xué)的問題
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 勢函數(shù)截?cái)嗑嚯x如何取？
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 【500金幣本版活動(dòng)】“經(jīng)驗(yàn)力場分子模擬+第一性原理計(jì)算問題討論互助及資源共享”
已經(jīng)有82人回復(fù)
- 【原創(chuàng)】分子模擬實(shí)例與挑戰(zhàn)專題之二加速能量與力的計(jì)算
已經(jīng)有28人回復(fù)
- 【求助】計(jì)算庫倫相互作用
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 【轉(zhuǎn)帖】VASP和ABINIT優(yōu)缺點(diǎn)比較
已經(jīng)有18人回復(fù)
- 【求助】請(qǐng)教分子動(dòng)力學(xué)模擬
已經(jīng)有8人回復(fù)
magicmonk
至尊木蟲 (著名寫手)
- 應(yīng)助: 172 (高中生)
- 金幣: 11451.3
- 紅花: 24
- 帖子: 1124
- 在線: 3108.8小時(shí)
- 蟲號(hào): 1191315
- 注冊(cè): 2011-01-17
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
2樓2014-06-02 15:37:42
cenwanglai
榮譽(yù)版主 (知名作家)
老和山猥瑣派九段
- 應(yīng)助: 46 (小學(xué)生)
- 貴賓: 8.842
- 金幣: 7440.4
- 散金: 9654
- 紅花: 118
- 沙發(fā): 23
- 帖子: 5306
- 在線: 1961.4小時(shí)
- 蟲號(hào): 537452
- 注冊(cè): 2008-04-01
- 性別: GG
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
- 管轄: 仿真模擬
3樓2014-06-02 16:01:44
老虎大王
木蟲 (著名寫手)
- 模擬EPI: 17
- 應(yīng)助: 26 (小學(xué)生)
- 貴賓: 0.17
- 金幣: 4774.1
- 散金: 8
- 紅花: 42
- 帖子: 1361
- 在線: 215.2小時(shí)
- 蟲號(hào): 659094
- 注冊(cè): 2008-11-21
- 專業(yè): 金屬結(jié)構(gòu)材料
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
cenwanglai: 金幣+10, ★★★很有幫助, 感謝你的回復(fù)！ 2014-06-04 06:57:50
月只藍(lán): 金幣+1, 鼓勵(lì)交流！ 2014-06-16 19:24:41
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
cenwanglai: 金幣+10, ★★★很有幫助, 感謝你的回復(fù)！ 2014-06-04 06:57:50
月只藍(lán): 金幣+1, 鼓勵(lì)交流！ 2014-06-16 19:24:41
|
范德華力屬于長程引力，Cutoff不宜設(shè)置太小。但是設(shè)置太大了明顯大幅增加計(jì)算量，因此cutoff應(yīng)該設(shè)置成滿足計(jì)算精度的前提條件下的最小值。 如果勢函數(shù)中已經(jīng)規(guī)定了cutoff，那就不費(fèi)心了。 如果勢函數(shù)參數(shù)已經(jīng)確定，而cutoff不確定，那么cutoff定為多少合適呢？ 一般來說應(yīng)該做一個(gè)測試，設(shè)置不同的cutoff，如果有Rc1<Rc2，而相應(yīng)的能量和力，以及結(jié)構(gòu)參數(shù)RDF等的計(jì)算結(jié)果基本一樣，那么就設(shè)為Rc1。 |
4樓2014-06-03 09:29:31
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 cenwanglai 的主題更新
| 4 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 生物學(xué)一志愿985，分?jǐn)?shù)349求調(diào)劑 +4 | zxts12 2026-03-21 | 4/200 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 化學(xué)工程321分求調(diào)劑 +18 | 大米飯！ 2026-03-15 | 22/1100 |
|
|
|
[考研]
 一志愿東華大學(xué)控制學(xué)碩320求調(diào)劑
+3
|
Grand777 2026-03-21 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 326求調(diào)劑 +4 | mlpqaz03 2026-03-15 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +4 | 要好好無聊 2026-03-21 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 297求調(diào)劑 +11 | 戲精丹丹丹 2026-03-17 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 313求調(diào)劑 +4 | 肆叁貳壹22 2026-03-19 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 302求調(diào)劑 +12 | 呼呼呼。。。。 2026-03-17 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 279求調(diào)劑 +5 | 紅衣隱官 2026-03-21 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 332求調(diào)劑 +3 | 鳳凰院丁真 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 08工科 320總分 求調(diào)劑 +6 | 梨花珞晚風(fēng) 2026-03-17 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 324分 085600材料化工求調(diào)劑 +4 | llllkkkhh 2026-03-18 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿華中科技大學(xué)，080502，354分求調(diào)劑 +5 | 守候夕陽CF 2026-03-18 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿重慶大學(xué)085700資源與環(huán)境專碩，總分308求調(diào)劑 +3 | 墨墨漠 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 329求調(diào)劑 +9 | 想上學(xué)吖吖 2026-03-19 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 260求調(diào)劑 +3 | 朱芷琳 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿吉林大學(xué)材料學(xué)碩321求調(diào)劑 +11 | Ymlll 2026-03-18 | 15/750 |
|
|
|
[考研] 275求調(diào)劑 +4 | 太陽花天天開心 2026-03-16 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 070303 總分349求調(diào)劑 +3 | LJY9966 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 0856求調(diào)劑 +3 | 劉夢微 2026-03-15 | 3/150 |
|