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cenwanglai榮譽(yù)版主 (知名作家)
老和山猥瑣派九段
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[求助]
經(jīng)典分子動(dòng)力學(xué)截?cái)喟霃皆O(shè)置為多少比較合適？ 已有1人參與
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在DL_POLY中，截?cái)喟霃接袃蓚�(gè)：一個(gè)是總的截?cái)喟霃絚utoff，另外一個(gè)是范德華力截?cái)喟霃絩vdw cutoff. 程序要求rvdw cutoff <=cutoff. 我的問(wèn)題是，根據(jù)什么原則來(lái)設(shè)置cutoff呢？ （1）如果計(jì)算資源無(wú)限，原則上，是不是cutoff越大越好？ （2）是不是可以通過(guò)一個(gè)系列的測(cè)試來(lái)確定合理的cutoff: 按照一定間隔設(shè)置5~8個(gè)截?cái)喟霃剑嗤瑺顟B(tài)（nPVT)下,看系統(tǒng)平衡后的總能隨截?cái)喟霃降淖兓厔?shì)。 截?cái)喟霃皆酱�，總能越低，取總能趨于穩(wěn)定的最小截?cái)喟霃健?br /> （3）設(shè)置一套參數(shù)，計(jì)算可以與實(shí)驗(yàn)結(jié)果相比較的性質(zhì)，一次來(lái)判定參數(shù)設(shè)置的合理性。但我覺(jué)得，應(yīng)該先按照（2）的方式明確截?cái)喟霃降挠绊懸?guī)律，然后才考慮與實(shí)驗(yàn)結(jié)果的對(duì)比驗(yàn)證。因?yàn)椋词古c實(shí)驗(yàn)吻合的再好，但對(duì)其中的物理本質(zhì)和規(guī)律沒(méi)有理解到，不能算是好的模擬計(jì)算工作。 (4)具體到簡(jiǎn)單氣體分子（5個(gè)原子以下的氣體分子）體系，近常溫常壓下分子之間的距離在15~30埃；如果考慮200*200*300埃的大盒子，截?cái)喟霃揭话阍诙啻蠓秶? |
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老虎大王
木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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【答案】應(yīng)助回帖
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范德華力屬于長(zhǎng)程引力，Cutoff不宜設(shè)置太小。但是設(shè)置太大了明顯大幅增加計(jì)算量，因此cutoff應(yīng)該設(shè)置成滿足計(jì)算精度的前提條件下的最小值。 如果勢(shì)函數(shù)中已經(jīng)規(guī)定了cutoff，那就不費(fèi)心了。 如果勢(shì)函數(shù)參數(shù)已經(jīng)確定，而cutoff不確定，那么cutoff定為多少合適呢？ 一般來(lái)說(shuō)應(yīng)該做一個(gè)測(cè)試，設(shè)置不同的cutoff，如果有Rc1<Rc2，而相應(yīng)的能量和力，以及結(jié)構(gòu)參數(shù)RDF等的計(jì)算結(jié)果基本一樣，那么就設(shè)為Rc1。 |
4樓2014-06-03 09:29:31
magicmonk
至尊木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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