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如何用質(zhì)譜研究蛋白與藥物作用的分子量解析 已有3人參與
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Dionysius |
鐵桿木蟲 (正式寫手)
| 質(zhì)譜上即使測出蛋白質(zhì)與藥物分子量的累加又能說明什么?能說明藥物對蛋白質(zhì)起到了活性作用嗎?能起活性作用的藥物首先要對蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的活性中心起到選擇性激活或鎖死作用。具體就是蛋白質(zhì)活性部分的空間結(jié)構(gòu)由此發(fā)生選擇性變化,從而引起其他體內(nèi)連鎖活性反應(yīng)。怎么變化呢?可能性有許多種,比如總體上由大分子幾聚體變化成單體或另外幾聚體,或者局部結(jié)構(gòu)由一種特定構(gòu)象轉(zhuǎn)化成另一種構(gòu)象,比如某間斷的阿爾法螺旋體轉(zhuǎn)變成β-折疊等等構(gòu)象。這些很難用質(zhì)譜的分子量的量化來說明的。一般要從某一活性構(gòu)象的質(zhì)譜圖分布變化的結(jié)構(gòu)Profile做為標(biāo)記來識別。但能使蛋白質(zhì)質(zhì)譜圖分布發(fā)生變化的未必就是活性藥物,比如某些金屬離子也能與蛋白質(zhì)的表面氨基酸形成鹽橋而使分子構(gòu)象發(fā)生變化,但未必是活性構(gòu)象變化。所以單靠質(zhì)譜的分子量測定是不夠的。還要結(jié)合2,3維NMR輔助計算機結(jié)構(gòu)計算判斷立體結(jié)構(gòu)的改變,更主要的通過建立In vitro,In vivo的一系列體外細(xì)胞和動物實驗來建立質(zhì)譜標(biāo)記圖譜。有了這個平臺的建立,才能進行活性藥物的篩選。 |
木蟲 (正式寫手)
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