 |
 |
 |
| 24小時(shí)熱門(mén)版塊排行榜 |
- >論壇更新日志 (3912)
- >考研 (969)
- >導(dǎo)師招生 (810)
- >蟲(chóng)友互識(shí) (247)
- >文獻(xiàn)求助 (136)
- >休閑灌水 (95)
- >碩博家園 (81)
- >招聘信息布告欄 (46)
- >考博 (45)
- >博后之家 (30)
- >綠色求助(高懸賞) (29)
- >基金申請(qǐng) (24)
- >論文投稿 (20)
- >外文書(shū)籍求助 (9)
- >教師之家 (9)
- >攻關(guān)文獻(xiàn)(高獎(jiǎng)勵(lì)) (8)
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 8 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1070 | 回復(fù): 7 | ||
joyce79928銅蟲(chóng) (小有名氣)
|
[求助]
smeagol ERROR 已有2人參與
|
|
想請(qǐng)問(wèn)一下 在計(jì)算smeagol時(shí) output出現(xiàn)以下訊息 BulkTransport ERROR: Overlap to second nearest slabs: 2 Increase the size of the unit cell along z. 我的.fdf是網(wǎng)路上Si的教學(xué)檔 .psf是siesta網(wǎng)站上鎖下載的LDA贗勢(shì) 不知道問(wèn)題到底出在哪里... 小女子求助大家了... |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
085600，材料與化工321分，求調(diào)劑
已經(jīng)有13人回復(fù)
-
311求調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
348求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
0805求調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
266分，一志愿電氣工程，本科材料，求材料專業(yè)調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
385分 生物學(xué)（071000）求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
材料調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
一志愿北交大材料工程總分358
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
311求調(diào)劑
已經(jīng)有12人回復(fù)
-
319求調(diào)劑
已經(jīng)有11人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- SIESTA初安裝，TEST出現(xiàn)問(wèn)題
已經(jīng)有10人回復(fù)
- linux系統(tǒng)下 ifort的安裝
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 請(qǐng)教vasp安裝中的mpi安裝
已經(jīng)有16人回復(fù)
- 【求助】siesta 安裝出錯(cuò)
已經(jīng)有18人回復(fù)
- 【求助】smeagol并行計(jì)算失敗，求助
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 【求助】siesta運(yùn)行需要.psf文件嗎
已經(jīng)有4人回復(fù)
guohuazhong
至尊木蟲(chóng) (職業(yè)作家)
- 1ST強(qiáng)帖: 1
- 應(yīng)助: 52 (初中生)
- 貴賓: 0.032
- 金幣: 35131.5
- 散金: 5
- 紅花: 19
- 沙發(fā): 1
- 帖子: 3924
- 在線: 885.6小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 550098
- 注冊(cè): 2008-04-22
- 性別: GG
- 專業(yè): 凝聚態(tài)物性 II ：電子結(jié)構(gòu)
2樓2014-06-15 09:24:59
joyce79928
銅蟲(chóng) (小有名氣)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 44
- 紅花: 1
- 帖子: 64
- 在線: 23.9小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 2823689
- 注冊(cè): 2013-11-24
- 專業(yè): 材料冶金過(guò)程工程
|
這是我網(wǎng)路上下載的fdf檔 我有確認(rèn)過(guò)這unit cell應(yīng)該是沒(méi)有錯(cuò)的... 不知道問(wèn)題還有可能出在哪里呢? 謝謝 # ----------------------------------------------------------------------------- # FDF for silicon to use at Urbana School # ----------------------------------------------------------------------------- SystemName silicon # System description SystemLabel silicon # Label to be used for files NumberOfAtoms 2 NumberOfSpecies 1 %block ChemicalSpeciesLabel 1 14 Si # For each specie, atomic number & symbol %endblock ChemicalSpeciesLabel LatticeConstant 5.430 Ang %block LatticeVectors # Lattice vectors in units of LatticeConstant 0.500 0.500 0.000 0.500 0.000 0.500 0.000 0.500 0.500 %endblock LatticeVectors AtomicCoordinatesFormat ScaledCartesian # How are the coordinates scaled %block AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies 0.000 0.000 0.000 1 Si 0.250 0.250 0.250 1 Si %endblock AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies |
3樓2014-06-16 16:11:10
joyce79928
銅蟲(chóng) (小有名氣)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 44
- 紅花: 1
- 帖子: 64
- 在線: 23.9小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 2823689
- 注冊(cè): 2013-11-24
- 專業(yè): 材料冶金過(guò)程工程
|
以下是我的Si.out siesta: System type = bulk siesta: k-grid: Number of k-points = 4 siesta: k-grid: Cutoff = 3.840 Ang siesta: k-grid: Supercell and displacements siesta: k-grid: 2 0 0 0.500 siesta: k-grid: 0 2 0 0.500 siesta: k-grid: 0 0 2 0.500 siesta: overlap: rmaxh veclen direction siesta: overlap: 16.4146 7.2558 1 siesta: overlap: rmaxh veclen direction siesta: overlap: 16.4146 7.2558 2 siesta: overlap: rmaxh veclen direction siesta: overlap: 16.4146 7.2558 3 BulkTransport ERROR: Overlap to second nearest slabs: 2 Increase the size of the unit cell along z. 是不是在KPOINTS有些問(wèn)題? |
4樓2014-06-16 16:38:09
joyce79928
銅蟲(chóng) (小有名氣)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 44
- 紅花: 1
- 帖子: 64
- 在線: 23.9小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 2823689
- 注冊(cè): 2013-11-24
- 專業(yè): 材料冶金過(guò)程工程
|
不知道為什么他有很多個(gè)output呢? 以下是另一個(gè)output.out -------------------------------------------------------------------------- A deprecated MCA parameter value was specified in the environment or on the command line. Deprecated MCA parameters should be avoided; they may disappear in future releases. Deprecated parameter: pls_rsh_agent -------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------- MPI_ABORT was invoked on rank 7 in communicator MPI_COMM_WORLD with errorcode 1. NOTE: invoking MPI_ABORT causes Open MPI to kill all MPI processes. You may or may not see output from other processes, depending on exactly when Open MPI kills them. -------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------- mpirun has exited due to process rank 1 with PID 18615 on node node21 exiting without calling "finalize". This may have caused other processes in the application to be terminated by signals sent by mpirun (as reported here). -------------------------------------------------------------------------- [node21:18613] 12 more processes have sent help message help-mpi-api.txt / mpi-abort [node21:18613] Set MCA parameter "orte_base_help_aggregate" to 0 to see all help / error messages Job Ended at Sun Jun 15 12:36:33 CST 2014 =========================================================================== totally spend,0,days,0,hours,0,minute,1,seconds |
5樓2014-06-16 16:53:35
zhangguangping
木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
- 1ST強(qiáng)帖: 23
- 應(yīng)助: 71 (初中生)
- 貴賓: 0.031
- 金幣: 1973.1
- 散金: 9059
- 紅花: 79
- 帖子: 2681
- 在線: 2128.8小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 529624
- 注冊(cè): 2008-03-20
- 性別: GG
- 專業(yè): 原子和分子物理
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
joyce79928: 金幣+7 2014-06-20 18:07:44
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
joyce79928: 金幣+7 2014-06-20 18:07:44
| 將你的電極在z方向上再重復(fù)上一個(gè)單元。如果是的是ABC結(jié)構(gòu)，那么修改為ABCABC.如果是A結(jié)構(gòu)，那么試試AA，如果是AB，試試ABAB。直到這個(gè)錯(cuò)誤消失。這個(gè)錯(cuò)誤與你的基函數(shù)的大小也有關(guān)。你的基函數(shù)越大，這個(gè)錯(cuò)誤本來(lái)不出現(xiàn)的也會(huì)出現(xiàn)。因此，如果要用示例的輸入文件，那么也要一起用示例的贗勢(shì)。 |
6樓2014-06-16 20:34:18
joyce79928
銅蟲(chóng) (小有名氣)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 44
- 紅花: 1
- 帖子: 64
- 在線: 23.9小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 2823689
- 注冊(cè): 2013-11-24
- 專業(yè): 材料冶金過(guò)程工程
7樓2014-06-17 15:23:34
joyce79928
銅蟲(chóng) (小有名氣)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 44
- 紅花: 1
- 帖子: 64
- 在線: 23.9小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 2823689
- 注冊(cè): 2013-11-24
- 專業(yè): 材料冶金過(guò)程工程
8樓2014-06-20 14:48:18
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 joyce79928 的主題更新
| 8 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 348求調(diào)劑 +3 | 吳彥祖24k 2026-04-02 | 3/150 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 085601一志愿中山大學(xué)深圳材料工程330求調(diào)劑 +7 | pipiver 2026-03-30 | 7/350 |
|
|
[考研] 302求調(diào)劑一志愿北航070300，本科鄭大化學(xué) +8 | 圣日耳曼條 2026-04-01 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 085410 一志愿211 22408分?jǐn)?shù)359求調(diào)劑 +3 | 123456789qw 2026-03-31 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 266分，一志愿電氣工程，本科材料，求材料專業(yè)調(diào)劑 +8 | 哇呼哼呼哼 2026-04-01 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 070300一志愿211，312分求調(diào)劑院校 +14 | 小黃鴨寶 2026-03-30 | 14/700 |
|
|
|
[考研] 320分，材料與化工專業(yè)，求調(diào)劑 +14 | 一定上岸aaa 2026-03-27 | 18/900 |
|
|
|
[考研] 一志愿西安交大材料學(xué)碩（英一數(shù)二）347，求調(diào)劑到高分子/材料相關(guān)專業(yè) +7 | zju51 2026-03-31 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 0703求調(diào)劑 +4 | zizimo 2026-03-31 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 086000生物與醫(yī)藥298調(diào)劑求助 +4 | 元元青青 2026-03-31 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 考研生物與醫(yī)藥調(diào)劑 +7 | 鐵憨憨123425 2026-03-31 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué) +20 | 妮妮ninicgb 2026-03-27 | 20/1000 |
|
|
|
[考研] 一志愿大連理工大學(xué)，機(jī)械工程學(xué)碩，341 +3 | 西瓜田的守望者 2026-03-30 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 370求調(diào)劑 +3 | 080700調(diào)劑 2026-03-30 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 283求調(diào)劑（080500） +14 | A child 2026-03-27 | 14/700 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑，一志愿 南京航空航天大學(xué)大學(xué) ，080500材料科學(xué)與工程學(xué)碩 +6 | @taotao 2026-03-26 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 2026年華南師范大學(xué)歡迎化學(xué)，化工，生物，生醫(yī)工等專業(yè)優(yōu)秀學(xué)子加入！ +3 | llss0711 2026-03-28 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 356求調(diào)劑 +3 | gysy?s?a 2026-03-28 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 394求調(diào)劑 +3 | 好事多磨靜候佳?/a> 2026-03-26 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 292求調(diào)劑 +4 | 求求了收下我吧?/a> 2026-03-26 | 4/200 |
|