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haiyanqian木蟲 (小有名氣)
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[求助]
膜蛋白分子動力學(xué)模擬體系的構(gòu)建
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| 本人想做跨膜蛋白的分子動力學(xué)模擬，蛋白同源模建后嵌入磷脂雙分子層模型中，然后用Amber跑分子動力學(xué)。我的跨膜蛋白屬于GPCR家族的，起初我是找了個rhodopsin加好膜和水的體系，我的蛋白跟rhodopsin的疊合后，將我的蛋白merge進去，然后保留了原來的膜和水。現(xiàn)在有個問題就是水層，因為loop區(qū)不一樣，所以水層保留rhodopsin的水層會不會有問題？還有如果這種方法不行的話，怎樣對已經(jīng)加好的膜只加水層呢？急急急�。�！在線等，麻煩哪位大俠給指導(dǎo)一下，不甚感激~~~ |
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3樓2021-08-07 20:05:16
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本帖內(nèi)容被屏蔽 |
2樓2018-08-07 01:07:11
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