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[求助]
如何從判斷一個蛋白有無糖基化磷酸化，求助理論大牛 已有3人參與
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如何從判斷一個蛋白有無糖基化磷酸化，求助理論大牛： 1.能否從一個蛋白的功能或者來源上就判斷其是否有被N糖基化的可能 2.能否從一個蛋白的功能或者來源上就判斷其是否有被O糖基化的可能 3.能否從一個蛋白的功能或者來源上就判斷其是否有被磷酸化的可能 人們常說分泌蛋白來自高爾基體，O糖基化是在高爾基體進行。但是當(dāng)我們拿到一個蛋白假如UNIPROT iD: Q8NHM5 .我們在知道其功能和在細胞內(nèi)定位的前提下。怎么才能知道以上三條。 我需要將大量蛋白進行分類。我期望能夠在前期直接判斷某個蛋白是否可能被修飾過。 多謝 |
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 蛋白質(zhì)生物學(xué)實驗經(jīng)驗 |
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凌波麗
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
東湖渡者: 金幣+5, ★有幫助, 牛人，拜讀 2014-07-21 21:26:05
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
東湖渡者: 金幣+5, ★有幫助, 牛人，拜讀 2014-07-21 21:26:05
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請參見： 蛋白質(zhì)的共價修飾的測定的試驗方法-----凌波麗個人總結(jié)（實例版） http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=6454508 詳細內(nèi)容以后再討論。 我這個貼子也該再版了。 |
3樓2014-07-17 03:46:29
loveskyzhou
鐵蟲 (正式寫手)
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2樓2014-07-16 12:51:51
jurkat.1640
至尊木蟲 (文壇精英)
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4樓2014-07-17 17:04:16
acvhreinlg
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
東湖渡者: 金幣+5, ★有幫助, 謝謝，我這些工具都會用，但是我現(xiàn)在工作性質(zhì)原因，要處理上千個這樣的蛋白。這些軟件或者工具的算法很經(jīng)典，但用這些工具進行預(yù)測會錯殺很多無修飾的殘基或者選擇了被修飾過的。 2014-07-21 21:29:01
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
東湖渡者: 金幣+5, ★有幫助, 謝謝，我這些工具都會用，但是我現(xiàn)在工作性質(zhì)原因，要處理上千個這樣的蛋白。這些軟件或者工具的算法很經(jīng)典，但用這些工具進行預(yù)測會錯殺很多無修飾的殘基或者選擇了被修飾過的。 2014-07-21 21:29:01
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磷酸化和N糖基化有預(yù)測工具，應(yīng)該比較可信，其糖基化的位點好像ser，O 糖就復(fù)雜了，一般要進行質(zhì)譜鑒定，可以用一些凝集素和抗體檢測，功能上不行吧，糖基化很廣泛，但這些糖蛋白的功能也不一樣，像GPI錨定蛋白好像也是可以預(yù)測的，但還是要用特定的酶去水解 [ 發(fā)自小木蟲客戶端 ] |
5樓2014-07-17 18:37:26
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