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Changhua1989新蟲 (初入文壇)
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[求助]
表觀遺傳學(xué)實(shí)驗(yàn)——染色質(zhì)免疫沉淀相關(guān)問題？ 已有2人參與
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本人之前是做微生物分子生態(tài)學(xué)的，最近由于工作需要，在學(xué)習(xí)表觀遺傳學(xué)，以前做學(xué)生沒好好學(xué)分子生物學(xué)，現(xiàn)在看遺傳這方面真是云里霧里的， 其中關(guān)于染色質(zhì)免疫沉淀實(shí)驗(yàn)部分，一直搞不懂，它的研究目的是體內(nèi)DNA與蛋白質(zhì)相互作用，問幾個(gè)問題：1. 這里的蛋白質(zhì)，是不是就只是指組蛋白？ 2. DNA從組蛋白分開來不是拿去測序了嗎？這時(shí)組蛋白作什么用？怎么研究它們間的關(guān)系？ 3. 實(shí)驗(yàn)中用抗原抗體的方法進(jìn)行沉淀，這里的抗體是針對組蛋白設(shè)計(jì)的嗎？ 4. 組蛋白不是都一樣嗎？難道不同基因的組蛋白不同？ 5. DNA拿去測序，也不能了解其甲基化情況吧？那測序到底什么用處？ 問的問題很幼稚，還請學(xué)霸們耐心解答！非常感謝！ |
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totoro626
新蟲 (初入文壇)
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“要對B基因的調(diào)控順序進(jìn)行分析預(yù)測，看上面有哪些可能的response elements，也就是可能的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)或反應(yīng)元件” 這個(gè)是通過生物信息學(xué)的方法進(jìn)行預(yù)測再實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證嗎，感覺promoter的預(yù)測網(wǎng)站比較雜，有什么好的推薦嗎，看文獻(xiàn)都是已經(jīng)有結(jié)果的驗(yàn)證過程，但看不到如何尋找可能有調(diào)控關(guān)系的a蛋白的思路啊，馬上要做的實(shí)驗(yàn)就是相關(guān)內(nèi)容，很擔(dān)心沒有結(jié)果應(yīng)該如何尋找相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子 |
12樓2015-01-12 09:21:41
蜂鳥404
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【答案】應(yīng)助回帖
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不止是組蛋白吧，組蛋白是否一樣我不知道，但還有一種叫轉(zhuǎn)錄因子的蛋白也能和DNA相互作用從而直接或間接調(diào)控基因的表達(dá)，一般研究轉(zhuǎn)錄因子就要研究它調(diào)控的基因，和它具體和DNA哪一段序列結(jié)合，這是做免疫共沉淀后對DNA測序就有必要了 [ 發(fā)自小木蟲客戶端 ] |
2樓2014-07-27 11:32:59
Changhua1989
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3樓2014-07-27 14:25:20
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4樓2014-07-27 14:42:31
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