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趙紅霞

鐵桿木蟲 (著名寫手)

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專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)

[求助] MS-力場分配問題

我想用MS的Forcite模塊做動(dòng)力學(xué)，模型是一個(gè)有機(jī)分子（只包含C、H、O）在溶液盒子中，分子帶了部分負(fù)電荷（羧基，含有一個(gè)C=O雙鍵），
溶液中添加了Na離子，整體呈電中性。在做動(dòng)力學(xué)之前，進(jìn)行構(gòu)型優(yōu)化的輸出文件（詳見下文）提醒部分鍵沒有分配到力場，
可是我的模型我已經(jīng)用discover中的typing選項(xiàng) calculate過了。請高手指教。
---- Geometry optimization parameters ----

Algorithm                      : Conjugate gradient
Convergence tolerance:
  Energy                      : 0.0001 kcal/mol
  Force                      : 0.005 kcal/mol/A
  Stress                      : 0.005 GPa
  Displacement                : 5e-005 A
Maximum number of iterations : 200
External pressure             : 0 GPa
Motion groups rigid          : NO
Optimize cell                : NO

---- Energy parameters ----

Forcefield                   : COMPASS
Electrostatic terms:
  Summation method             : Ewald
  Accuracy                   : 0.0001 kcal/mol
  Buffer width                : 0.5 A

van der Waals terms:
  Summation method             : Atom based
  Truncation method          : Cubic spline
  Cutoff distance             : 12.5 A
  Spline width                : 1 A
  Buffer width                : 0.5 A

2 bond stretch(s) have been deleted from the energy expression as they have no forcefield parameters.
6 inversion(s) have been deleted from the energy expression as they have no forcefield parameters.

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1樓 2014-08-21 20:36:11

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我又用cvff力場試了試，還是提示：6 inversion(s) have been deleted from the energy expression as they have no forcefield parameters.
請高手指教

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2樓2014-08-22 10:10:55