 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
小木蟲論壇-學術(shù)科研互動平臺 » 計算模擬區(qū) » 分子模擬 » MS » MS-力場分配問題
| 2 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1647 | 回復: 1 | ||
趙紅霞鐵桿木蟲 (著名寫手)
|
[求助]
MS-力場分配問題
|
|
我想用MS的Forcite模塊做動力學，模型是一個有機分子（只包含C、H、O）在溶液盒子中，分子帶了部分負電荷（羧基，含有一個C=O雙鍵）， 溶液中添加了Na離子，整體呈電中性。在做動力學之前，進行構(gòu)型優(yōu)化的輸出文件（詳見下文）提醒部分鍵沒有分配到力場， 可是我的模型我已經(jīng)用discover中的typing選項 calculate過了。請高手指教。 ---- Geometry optimization parameters ---- Algorithm : Conjugate gradient Convergence tolerance: Energy : 0.0001 kcal/mol Force : 0.005 kcal/mol/A Stress : 0.005 GPa Displacement : 5e-005 A Maximum number of iterations : 200 External pressure : 0 GPa Motion groups rigid : NO Optimize cell : NO ---- Energy parameters ---- Forcefield : COMPASS Electrostatic terms: Summation method : Ewald Accuracy : 0.0001 kcal/mol Buffer width : 0.5 A van der Waals terms: Summation method : Atom based Truncation method : Cubic spline Cutoff distance : 12.5 A Spline width : 1 A Buffer width : 0.5 A 2 bond stretch(s) have been deleted from the energy expression as they have no forcefield parameters. 6 inversion(s) have been deleted from the energy expression as they have no forcefield parameters. |
回復此樓» 猜你喜歡
求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復
-
265求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復
-
085700資源與環(huán)境308求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復
-
一志愿吉林大學材料學碩321求調(diào)劑
已經(jīng)有12人回復
-
286分人工智能專業(yè)請求調(diào)劑愿意跨考！
已經(jīng)有3人回復
-
329求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復
-
申請回稿延期一個月，編輯同意了。但系統(tǒng)上的時間沒變，給編輯又寫郵件了，沒回復
已經(jīng)有4人回復
-
材料學碩318求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復
-
一志愿中國海洋大學，生物學，301分，求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復
-
081700化工學碩調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 粗�；Ｐ徒Ｖ蠓峙淞鰡栴}
已經(jīng)有14人回復
- CH4在MOF-5中的自擴散系數(shù)計算
已經(jīng)有29人回復
- Material studio軟件中Forcite模塊結(jié)構(gòu)優(yōu)化時的參數(shù)設(shè)置問題
已經(jīng)有13人回復
- 急急急！forcite里面如何為同一元素不同價態(tài)原子分配不同的力場？
已經(jīng)有11人回復
- MS discover模塊計算問題
已經(jīng)有6人回復
- MS的力場文件函數(shù)如何調(diào)用
已經(jīng)有5人回復
- MS中compass力場算TiO2一直出錯
已經(jīng)有5人回復
- 急求解答，關(guān)于力場的電荷參數(shù)�。。�
已經(jīng)有4人回復
- 關(guān)于MS力場編輯
已經(jīng)有11人回復
- MS中sorption模塊使用自定義力場出現(xiàn)的問題
已經(jīng)有26人回復
- 使用COMPASS 力場的同學請注意
已經(jīng)有7人回復
- ATP分子力場參數(shù)怎么做
已經(jīng)有4人回復
- 請教關(guān)于materials studio建模和OPLS力場
已經(jīng)有7人回復
- 【求助】ReaxFF 力場參數(shù)化問題請教
已經(jīng)有9人回復
- 【求助】請問如何下載OPLS-AA力場
已經(jīng)有7人回復
- 【討論】分子模擬中力場參數(shù)的調(diào)節(jié)討論
已經(jīng)有7人回復
- 【求助】MS的Amorphous cell使用出問題
已經(jīng)有16人回復
- 【其他】開個帖子討論下MS中sorption模塊的運用
已經(jīng)有13人回復
- 【求助】水盒子問題
已經(jīng)有17人回復
趙紅霞
鐵桿木蟲 (著名寫手)
- 應(yīng)助: 73 (初中生)
- 金幣: 6197.9
- 散金: 141
- 紅花: 33
- 帖子: 1541
- 在線: 700小時
- 蟲號: 1544094
- 注冊: 2011-12-20
- 性別: MM
- 專業(yè): 理論和計算化學
2樓2014-08-22 10:10:55
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 Andsharia 的主題更新
| 2 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 一志愿吉林大學材料學碩321求調(diào)劑 +9 | Ymlll 2026-03-18 | 12/600 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 一志愿武漢理工材料工程專碩調(diào)劑 +5 | Doleres 2026-03-19 | 5/250 |
|
|
[考研] 288求調(diào)劑，一志愿華南理工大學071005 +5 | ioodiiij 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 【考研調(diào)劑】化學專業(yè) 281分，一志愿四川大學，誠心求調(diào)劑 +5 | 吃吃吃才有意義 2026-03-19 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +3 | Mqqqqqq 2026-03-19 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 287求調(diào)劑 +3 | 晨昏線與星海 2026-03-19 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +6 | 司空. 2026-03-18 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 311求調(diào)劑 +4 | 冬十三 2026-03-18 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 328求調(diào)劑，英語六級551，有科研經(jīng)歷 +3 | 生物工程調(diào)劑 2026-03-17 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 085601專碩，總分342求調(diào)劑，地區(qū)不限 +5 | share_joy 2026-03-16 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 298-一志愿中國農(nóng)業(yè)大學-求調(diào)劑 +7 | 手機用戶 2026-03-17 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 環(huán)境工程調(diào)劑 +8 | 大可digkids 2026-03-16 | 8/400 |
|
|
|
[基金申請] 被我言中：新模板不強調(diào)格式了，假專家開始管格式了 +4 | beefly 2026-03-14 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 274求調(diào)劑 +5 | 時間點 2026-03-13 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 277材料科學與工程080500求調(diào)劑 +3 | 自由煎餅果子 2026-03-16 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0856專碩279求調(diào)劑 +5 | 加油加油！? 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 中科大材料與化工319求調(diào)劑 +3 | 孟鑫材料 2026-03-14 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 材料與化工 323 英一+數(shù)二+物化，一志愿：哈工大 本人本科雙一流 +4 | 自由的_飛翔 2026-03-13 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 070303一志愿西北大學學碩310找調(diào)劑 +3 | d如愿上岸 2026-03-13 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 290求調(diào)劑 +3 | ADT 2026-03-13 | 3/150 |
|