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glide分子對接配體準(zhǔn)備問題
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我想用glide做分子對接，蛋白已經(jīng)知道怎么準(zhǔn)備，但在用ligpre模塊準(zhǔn)備配體時，生成三個文件ligprep_15.inp；ligprep_15.log；ligprep_15-out.maegz。有人說對接時用的是第三個文件，但ligprep_15-out.maegz什么也沒有，查看ligprep_15.log時，發(fā)現(xiàn)有一處錯誤： ligprep running: premin OK structures in: ligprep_15-out_subjob_1_prout.maegz problematic structures in: ligprep_15-out_subjob_1_prout_bad.maegz premin -lic ligprep -m filter -f 14 -s ligprep_15-out_subjob_1_prout.maegz -u ligprep_15-out_subjob_1_prout_bad.maegz ligprep_15-out_subjob_1_rcout.maegz > ligprep_15-out_subjob_1_pr.log 2>&1 **** ERROR : premin produced no output structures **** Last 30 lines of ligprep_15-out_subjob_1_pr.log: Premin Premin. Copyright Schrodinger, LLC. All rights reserved. 不知道這種錯誤是什么樣的錯誤，問題出在哪，請大俠幫下忙，非常感謝。。。。 |
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