 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 10 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 4119 | 回復(fù): 9 | |||
sddtc888至尊木蟲 (著名寫手)
Hψ=Eψ S=klnΩ dS≥δQ/T
|
[求助]
求助關(guān)于過渡態(tài)輸入文件問題 已有3人參與
|
|
我要找一個(gè)過渡態(tài)，輸入文件如下，但是我一運(yùn)行Guassian就報(bào)錯(cuò)： Old curvilinear step not converged, using linear step: SCX= 7.85D+00 DXMaxT= 1.77-317 SCLim= 0.00D+00 Fact= 0.00D+00 RedCar/ORedCr failed for GTrans. Error termination via Lnk1e in /opt/g09/l101.exe at Tue Oct 21 21:39:44 2014. Job cpu time: 0 days 0 hours 1 minutes 15.0 seconds. File lengths (MBytes): RWF= 5 Int= 0 D2E= 0 Chk= 1 Scr= 1 求助怎么辦？是不是我初始結(jié)構(gòu)沒設(shè)置好？還有關(guān)于原子順序必需一致，我已經(jīng)做到一致了（我用gview分別畫了初始結(jié)構(gòu)和最后結(jié)構(gòu)，原子序號(hào)和元素符號(hào)我都對好了的） 輸入文件如下： %nprocshared=8 %mem=8GB %chk=mg4-h2-qst2.chk #p opt(calcfc,qst2,maxcycle=2000) freq=noraman b3pw91/6-311+g(d,p) empiricaldispersion=gd3 scf(maxcycle=2000,conver=6) nosymm mg4-h2-qst2 0 1 Mg -2.91504837 1.26284766 1.92151075 Mg -6.05287528 0.15350234 0.00000000 Mg -2.91508887 -2.06530526 0.00000000 Mg -2.91504837 1.26284766 -1.92151075 H -2.09425764 -4.95707567 0.32908968 H -1.73598875 -4.83041338 -0.32908968 mg4-h2-qst2 0 1 Mg 1.12634400 -1.03183000 -0.98056000 Mg 1.12757200 1.03115000 0.98044700 Mg -1.12733800 -0.98027800 1.03142900 Mg -1.12657400 0.98095100 -1.03131800 H 2.44087300 -0.00116900 -0.00039100 H -2.44092400 0.00124900 0.00041300 @Civolf 謝謝�。。�！ |
回復(fù)此樓» 本帖附件資源列表
-
歡迎監(jiān)督和反饋：小木蟲僅提供交流平臺(tái)，不對該內(nèi)容負(fù)責(zé)。
本內(nèi)容由用戶自主發(fā)布，如果其內(nèi)容涉及到知識(shí)產(chǎn)權(quán)問題，其責(zé)任在于用戶本人，如對版權(quán)有異議，請聯(lián)系郵箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : mg4-h2-qst2.com
2014-10-21 22:17:13, 941 bytes
» 收錄本帖的淘帖專輯推薦
 計(jì)算化學(xué) |
» 猜你喜歡
汕頭大學(xué)化學(xué)招調(diào)劑，相關(guān)內(nèi)容如下。
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
大灣區(qū)大學(xué)（籌）劉天輝課題組招收博士生（與中山大學(xué)物理學(xué)院聯(lián)合培養(yǎng)）
已經(jīng)有16人回復(fù)
-
物理化學(xué)論文潤色/翻譯怎么收費(fèi)?
已經(jīng)有257人回復(fù)
-
PbS量子點(diǎn)如何確定濃度
已經(jīng)有11人回復(fù)
-
大灣區(qū)大學(xué)劉天輝課題組招收2026級(jí)博士生（與中山大學(xué)物理學(xué)院聯(lián)合培養(yǎng)）
已經(jīng)有22人回復(fù)
-
PbS量子點(diǎn)紫外吸收
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
比利時(shí)魯汶大學(xué)與國家留學(xué)基金委共同資助博士研究生CSC-KU Leuven PhD Scholarship
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
七嗪類物質(zhì)合成求助
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
半透性容器進(jìn)行高濕或者低濕研究
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
倫敦大學(xué)學(xué)院Benjamin Moss博士招收人工智能、原位光譜、催化相關(guān)26年博士生
已經(jīng)有11人回復(fù)
-
中國科學(xué)院成都山地災(zāi)害與環(huán)境研究所2026年特別研究助理（博士后）招聘啟事
已經(jīng)有0人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 求助：如何寫兩個(gè)NO分解成一個(gè)N2和O2的過渡態(tài)，和反應(yīng)歷程，能量變化？
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 過渡態(tài)優(yōu)化問題求助
已經(jīng)有13人回復(fù)
- 新手求助高斯輸入文件寫法，求大神幫忙
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 為什么會(huì)出現(xiàn)l9999錯(cuò)誤及過渡態(tài)初始結(jié)構(gòu)怎么設(shè)定？
已經(jīng)有14人回復(fù)
- gaussian優(yōu)化l103錯(cuò)誤求助
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 計(jì)算過渡態(tài)報(bào)l999錯(cuò)誤
已經(jīng)有12人回復(fù)
- GaussianView內(nèi)坐標(biāo)格式的輸入文件解釋和QST2問題?
已經(jīng)有7人回復(fù)
- shapefile文件屬性表中添加屬性出錯(cuò)
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 怎么尋找過渡態(tài)和中間體
已經(jīng)有11人回復(fù)
- vasp計(jì)算過渡態(tài)問題
已經(jīng)有13人回復(fù)
- 求助SiH2 + H2 --> SiH4過渡態(tài)的計(jì)算
已經(jīng)有12人回復(fù)
- Gaussian 03計(jì)算過渡態(tài)問題
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 模擬鍵的斷裂是不是不需要做過渡態(tài)的計(jì)算？
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 【求助】opt=QST2輸入方法
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 【求助】在gaussian過渡態(tài)優(yōu)化計(jì)算出現(xiàn)的問題~請教高手~
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 【求助】用vasp搜尋過渡態(tài)的請進(jìn)
已經(jīng)有16人回復(fù)
- 【求助】怎樣把ChemBio 3D 文件轉(zhuǎn)化為 Gaussian 輸入文件
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 【求助】請教一個(gè)關(guān)于gaussian的問題
已經(jīng)有17人回復(fù)
- 【求助】求助高手一個(gè)做過渡態(tài)輸入文件的問題
已經(jīng)有6人回復(fù)
G09QC
木蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 9 (幼兒園)
- 金幣: 6236.9
- 帖子: 38
- 在線: 17.1小時(shí)
- 蟲號(hào): 1999593
- 注冊: 2012-09-14
- 性別: GG
- 專業(yè): 物理有機(jī)化學(xué)
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
sddtc888: 金幣+200, ★★★★★最佳答案, 謝謝！ 2014-10-25 13:52:22
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
sddtc888: 金幣+200, ★★★★★最佳答案, 謝謝！ 2014-10-25 13:52:22
|
該問題是由于反應(yīng)物和產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)相差過大，無法產(chǎn)生合適的內(nèi)坐標(biāo)而引起的。 解決方法是添加合適的虛擬鍵，使得反應(yīng)物和產(chǎn)物具有相同的connectivity，這樣有助于程序產(chǎn)生合適的內(nèi)坐標(biāo) 另外，maxcycle=2000不推薦，通常不能解決問題，還浪費(fèi)計(jì)算時(shí)間；DFT缺省freq=noraman，所以只需寫freq #p opt=(calcfc,qst2) freq b3pw91/6-311+g(d,p) nosymm geom=connectivity empiricaldispersion=gd3 mg4-h2-qst2 0 1 Mg -2.91504837 1.26284766 1.92151075 Mg -6.05287528 0.15350234 0.00000000 Mg -2.91508887 -2.06530526 0.00000000 Mg -2.91504837 1.26284766 -1.92151075 H -2.09425764 -4.95707567 0.32908968 H -1.73598875 -4.83041338 -0.32908968 1 2 0.5 5 0.5 3 0.5 4 0.5 2 5 0.5 4 0.5 3 4 0.5 6 0.5 4 6 0.5 5 6 0.5 6 mg4-h2-qst2 0 1 Mg 1.12634400 -1.03183000 -0.98056000 Mg 1.12757200 1.03115000 0.98044700 Mg -1.12733800 -0.98027800 1.03142900 Mg -1.12657400 0.98095100 -1.03131800 H 2.44087300 -0.00116900 -0.00039100 H -2.44092400 0.00124900 0.00041300 1 2 1.0 5 0.5 3 0.5 2 5 0.5 4 0.5 3 0.5 3 4 1.0 6 0.5 4 6 0.5 5 6 0.5 6 |
2樓2014-10-22 06:29:06
槍下游魂
木蟲 (著名寫手)
- 應(yīng)助: 718 (博后)
- 金幣: 8336.9
- 散金: 175
- 紅花: 80
- 帖子: 1498
- 在線: 542.6小時(shí)
- 蟲號(hào): 2620258
- 注冊: 2013-08-28
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
3樓2014-10-22 07:40:41
G09QC
木蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 9 (幼兒園)
- 金幣: 6236.9
- 帖子: 38
- 在線: 17.1小時(shí)
- 蟲號(hào): 1999593
- 注冊: 2012-09-14
- 性別: GG
- 專業(yè): 物理有機(jī)化學(xué)
4樓2014-10-22 07:56:54
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
|
本帖內(nèi)容被屏蔽 |
5樓2014-10-22 08:27:15
槍下游魂
木蟲 (著名寫手)
- 應(yīng)助: 718 (博后)
- 金幣: 8336.9
- 散金: 175
- 紅花: 80
- 帖子: 1498
- 在線: 542.6小時(shí)
- 蟲號(hào): 2620258
- 注冊: 2013-08-28
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
6樓2014-10-22 09:06:00
G09QC
木蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 9 (幼兒園)
- 金幣: 6236.9
- 帖子: 38
- 在線: 17.1小時(shí)
- 蟲號(hào): 1999593
- 注冊: 2012-09-14
- 性別: GG
- 專業(yè): 物理有機(jī)化學(xué)
|
那就對了，你說的就是 “@Civolf”，樓主應(yīng)該是希望Civolf這個(gè)ID給他回答吧 “@”在高斯中的意思就是在該處插入額外文件 http://www.gaussian.com/g_tech/g_ur/m_input.htm The contents of an external file may be included within a Gaussian 09 input file using the following syntax: @filename. This causes the entire file to be placed at the current location in the input stream. Appending /N to such commands will prevent the included file’s contents from being echoed at the start of the output file. |
7樓2014-10-22 10:14:18
G09QC
木蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 9 (幼兒園)
- 金幣: 6236.9
- 帖子: 38
- 在線: 17.1小時(shí)
- 蟲號(hào): 1999593
- 注冊: 2012-09-14
- 性別: GG
- 專業(yè): 物理有機(jī)化學(xué)
8樓2014-10-22 10:16:35
sddtc888
至尊木蟲 (著名寫手)
Hψ=Eψ S=klnΩ dS≥δQ/T
- 應(yīng)助: 181 (高中生)
- 貴賓: 2.508
- 金幣: 10753.4
- 散金: 1948
- 紅花: 29
- 沙發(fā): 1
- 帖子: 1609
- 在線: 1165.1小時(shí)
- 蟲號(hào): 1410152
- 注冊: 2011-09-20
- 性別: GG
- 專業(yè): 凝聚態(tài)物性 II ：電子結(jié)構(gòu)
|
我按照您的方法，結(jié)果算出來了，你看一下對不對！ 還有，我想問一下，有了log文件，怎么看過渡態(tài)的結(jié)構(gòu)，還有，怎么從log文件中看過渡態(tài)的頻率（主要想看看是不是只有一個(gè)虛頻），還有，過渡態(tài)每一步的能量怎么從log文件中提取 |
» 本帖附件資源列表
-
歡迎監(jiān)督和反饋：小木蟲僅提供交流平臺(tái)，不對該內(nèi)容負(fù)責(zé)。
本內(nèi)容由用戶自主發(fā)布，如果其內(nèi)容涉及到知識(shí)產(chǎn)權(quán)問題，其責(zé)任在于用戶本人，如對版權(quán)有異議，請聯(lián)系郵箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : mg4h2-qst2.log
2014-10-23 14:01:39, 1.58 M
9樓2014-10-23 14:01:13
G09QC
木蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 9 (幼兒園)
- 金幣: 6236.9
- 帖子: 38
- 在線: 17.1小時(shí)
- 蟲號(hào): 1999593
- 注冊: 2012-09-14
- 性別: GG
- 專業(yè): 物理有機(jī)化學(xué)
10樓2014-10-25 05:36:42
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 sddtc888 的主題更新
| 10 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 085600材料與化工306 +4 | z1z2z3879 2026-03-21 | 4/200 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 328求調(diào)劑，英語六級(jí)551，有科研經(jīng)歷 +5 | 生物工程調(diào)劑 2026-03-17 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 材料學(xué)碩301分求調(diào)劑 +7 | Liyouyumairs 2026-03-21 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 一志愿西安交通大學(xué)材料工程專業(yè) 282分求調(diào)劑 +10 | 楓橋ZL 2026-03-18 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 278求調(diào)劑 +9 | 煙火先于春 2026-03-17 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 311求調(diào)劑 +3 | 勇敢的小吳 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 生物學(xué)一志愿985，分?jǐn)?shù)349求調(diào)劑 +3 | zxts12 2026-03-21 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0805材料320求調(diào)劑 +3 | 深海物語 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 22 350 本科985求調(diào)劑，求老登收留 +3 | 李軼男003 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 南昌大學(xué)材料專碩311分求調(diào)劑 +6 | 77chaselx 2026-03-20 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 材料 336 求調(diào)劑 +3 | An@. 2026-03-18 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 294求調(diào)劑材料與化工專碩 +15 | 陌の森林 2026-03-18 | 15/750 |
|
|
|
[考研] 353求調(diào)劑 +3 | 拉鉤不許變 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 086500 325 求調(diào)劑 +3 | 領(lǐng)帶小熊 2026-03-19 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 08工學(xué)調(diào)劑 +5 | 用戶573181 2026-03-20 | 5/250 |
|
|
|
[考研]
 320求調(diào)劑0856
+3
|
不想起名字112 2026-03-19 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿985，本科211，0817化學(xué)工程與技術(shù)319求調(diào)劑 +10 | Liwangman 2026-03-15 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 312求調(diào)劑 +8 | 陌宸希 2026-03-16 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 考研求調(diào)劑 +3 | 橘頌. 2026-03-17 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 070300化學(xué)學(xué)碩求調(diào)劑 +6 | 太想進(jìn)步了0608 2026-03-16 | 6/300 |
|