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sddtc888至尊木蟲 (著名寫手)
Hψ=Eψ S=klnΩ dS≥δQ/T
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[求助]
求助關(guān)于過渡態(tài)輸入文件問題 已有3人參與
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我要找一個過渡態(tài)，輸入文件如下，但是我一運行Guassian就報錯： Old curvilinear step not converged, using linear step: SCX= 7.85D+00 DXMaxT= 1.77-317 SCLim= 0.00D+00 Fact= 0.00D+00 RedCar/ORedCr failed for GTrans. Error termination via Lnk1e in /opt/g09/l101.exe at Tue Oct 21 21:39:44 2014. Job cpu time: 0 days 0 hours 1 minutes 15.0 seconds. File lengths (MBytes): RWF= 5 Int= 0 D2E= 0 Chk= 1 Scr= 1 求助怎么辦？是不是我初始結(jié)構(gòu)沒設(shè)置好？還有關(guān)于原子順序必需一致，我已經(jīng)做到一致了（我用gview分別畫了初始結(jié)構(gòu)和最后結(jié)構(gòu)，原子序號和元素符號我都對好了的） 輸入文件如下： %nprocshared=8 %mem=8GB %chk=mg4-h2-qst2.chk #p opt(calcfc,qst2,maxcycle=2000) freq=noraman b3pw91/6-311+g(d,p) empiricaldispersion=gd3 scf(maxcycle=2000,conver=6) nosymm mg4-h2-qst2 0 1 Mg -2.91504837 1.26284766 1.92151075 Mg -6.05287528 0.15350234 0.00000000 Mg -2.91508887 -2.06530526 0.00000000 Mg -2.91504837 1.26284766 -1.92151075 H -2.09425764 -4.95707567 0.32908968 H -1.73598875 -4.83041338 -0.32908968 mg4-h2-qst2 0 1 Mg 1.12634400 -1.03183000 -0.98056000 Mg 1.12757200 1.03115000 0.98044700 Mg -1.12733800 -0.98027800 1.03142900 Mg -1.12657400 0.98095100 -1.03131800 H 2.44087300 -0.00116900 -0.00039100 H -2.44092400 0.00124900 0.00041300 @Civolf 謝謝！�。�！ |
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2014-10-21 22:17:13, 941 bytes
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 計算化學(xué) |
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sddtc888
至尊木蟲 (著名寫手)
Hψ=Eψ S=klnΩ dS≥δQ/T
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我按照您的方法，結(jié)果算出來了，你看一下對不對！ 還有，我想問一下，有了log文件，怎么看過渡態(tài)的結(jié)構(gòu)，還有，怎么從log文件中看過渡態(tài)的頻率（主要想看看是不是只有一個虛頻），還有，過渡態(tài)每一步的能量怎么從log文件中提取 |
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2014-10-23 14:01:39, 1.58 M
9樓2014-10-23 14:01:13
G09QC
木蟲 (初入文壇)
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
sddtc888: 金幣+200, ★★★★★最佳答案, 謝謝！ 2014-10-25 13:52:22
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該問題是由于反應(yīng)物和產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)相差過大，無法產(chǎn)生合適的內(nèi)坐標(biāo)而引起的。 解決方法是添加合適的虛擬鍵，使得反應(yīng)物和產(chǎn)物具有相同的connectivity，這樣有助于程序產(chǎn)生合適的內(nèi)坐標(biāo) 另外，maxcycle=2000不推薦，通常不能解決問題，還浪費計算時間；DFT缺省freq=noraman，所以只需寫freq #p opt=(calcfc,qst2) freq b3pw91/6-311+g(d,p) nosymm geom=connectivity empiricaldispersion=gd3 mg4-h2-qst2 0 1 Mg -2.91504837 1.26284766 1.92151075 Mg -6.05287528 0.15350234 0.00000000 Mg -2.91508887 -2.06530526 0.00000000 Mg -2.91504837 1.26284766 -1.92151075 H -2.09425764 -4.95707567 0.32908968 H -1.73598875 -4.83041338 -0.32908968 1 2 0.5 5 0.5 3 0.5 4 0.5 2 5 0.5 4 0.5 3 4 0.5 6 0.5 4 6 0.5 5 6 0.5 6 mg4-h2-qst2 0 1 Mg 1.12634400 -1.03183000 -0.98056000 Mg 1.12757200 1.03115000 0.98044700 Mg -1.12733800 -0.98027800 1.03142900 Mg -1.12657400 0.98095100 -1.03131800 H 2.44087300 -0.00116900 -0.00039100 H -2.44092400 0.00124900 0.00041300 1 2 1.0 5 0.5 3 0.5 2 5 0.5 4 0.5 3 0.5 3 4 1.0 6 0.5 4 6 0.5 5 6 0.5 6 |
2樓2014-10-22 06:29:06
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3樓2014-10-22 07:40:41
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4樓2014-10-22 07:56:54
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