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308350576新蟲(chóng) (初入文壇)
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關(guān)于6%的尿素聚丙烯酰胺變性凝膠來(lái)跑RNA的一些問(wèn)題
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由于是第一次做這個(gè),所以都是一大堆的問(wèn)題,希望大家多多發(fā)言,謝謝。 我要建RNA測(cè)序文庫(kù),要篩選50-500bp大小的RNA,但是考慮到要固定RNA的二級(jí)結(jié)構(gòu),所以,要用6%的尿素聚丙烯酰胺變性凝膠來(lái)跑,我用的marker是• Radiolabeled Decade and Century markers (Life Technologies)貨號(hào):am7778,這個(gè)marker,loading buffer是marker中帶的,現(xiàn)在問(wèn)題如下: 1.這個(gè)凝膠的配方是什么,是我們平時(shí)的蛋白膠的配方嗎?就是水,30%丙烯酰胺,tris,sds,過(guò)硫酸銨,temed?是只有分離膠,沒(méi)有濃縮膠哈? 2.電泳緩沖液的配方是什么,是我們平時(shí)跑蛋白的時(shí)候,用的tbe(tris,甘氨酸,edta)嗎?還是有什么新的配方。 3.試驗(yàn)中需要注意些什么?比如說(shuō),電泳的時(shí)候,電泳buffer中需要加些什么東西嗎?比如甲酰胺或者尿素,還有聽(tīng)說(shuō)在上樣的時(shí)候要吹上樣孔?就是用電泳buffer反復(fù)清洗上樣孔嗎? 4.試驗(yàn)中都要保證是RNase free環(huán)境嗎?怎么保證? 5.染膠用eb就可以嘛?切膠再在外線(xiàn)切膠臺(tái)就ok?拍照的話(huà),就是在紫外曝光儀中就可以嘛? 6.上樣的時(shí)候loading buffer中還要加其他東西嗎?像甲酰胺或者尿素之類(lèi)的。 7.還有就是甲酰胺或者尿素這個(gè)東西在這個(gè)實(shí)驗(yàn)中要用到嘛?在哪一步用到? 問(wèn)題就這么多?請(qǐng)大家踴躍發(fā)言,多謝多謝! |
銅蟲(chóng) (小有名氣)
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