 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 8 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1769 | 回復(fù): 7 | ||||
木頭珊瑚新蟲 (初入文壇)
|
[求助]
新手求助，需要用autodock做分子模擬、對(duì)接，求文件前期準(zhǔn)備操作及資源 已有1人參與
|
| 需要用autodock模擬大分子構(gòu)象，以及與小分子的對(duì)接，但是在準(zhǔn)備文件過程中，有一個(gè)prodrg2 server 難住我了，不知道這是什么，也不知道從哪弄來，還有PDB傷下載來的大分子PDB文件，我用寫字板打開的，很多很多字，但不像亂碼，不知道能不能用，也不知道該先怎么處理，現(xiàn)在是一片漿糊啊，求大神 |
回復(fù)此樓» 收錄本帖的淘帖專輯推薦
 仿真建模與計(jì)算 | 分子對(duì)接 |
» 猜你喜歡
一志愿西安交通大學(xué)材料工程專業(yè) 282分求調(diào)劑
已經(jīng)有13人回復(fù)
-
北科281學(xué)碩材料求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
328求調(diào)劑，英語(yǔ)六級(jí)551，有科研經(jīng)歷
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
298求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
310求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
311求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
307求調(diào)劑
已經(jīng)有11人回復(fù)
-
材料與化工085600，總分304，本科有兩篇sci參與，求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
315分，誠(chéng)求調(diào)劑，材料與化工085600
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
求調(diào)劑一志愿海大，0703化學(xué)學(xué)碩304分，有大創(chuàng)項(xiàng)目，四級(jí)已過
已經(jīng)有10人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- 在做AUTODOCK對(duì)接的時(shí)候，如何在圖上像是蛋白質(zhì)的殘基及序號(hào)呢？
已經(jīng)有3人回復(fù)
- autodock柔性對(duì)接缺少M(fèi)AP文件相關(guān)問題
已經(jīng)有8人回復(fù)
- autodock對(duì)接的氫鍵
已經(jīng)有7人回復(fù)
- autodock柔性對(duì)接
已經(jīng)有5人回復(fù)
- Autodock對(duì)接構(gòu)象準(zhǔn)確性的評(píng)價(jià)——RMSD
已經(jīng)有10人回復(fù)
- autodock對(duì)接時(shí)蛋白的處理問題
已經(jīng)有6人回復(fù)
- Autodock最后一步進(jìn)行不了，在線急等啊
已經(jīng)有6人回復(fù)
- Autodock中受體的準(zhǔn)備
已經(jīng)有14人回復(fù)
- 求助AUTODOCK中怎么移動(dòng)分子
已經(jīng)有4人回復(fù)
- Autodock的操作流程---win下
已經(jīng)有565人回復(fù)
- 使用autodock4.2處理分子對(duì)接問題，在run autogrid時(shí)總是出錯(cuò)，請(qǐng)各位高人指點(diǎn)�。�？
已經(jīng)有10人回復(fù)
- AUTODOCK對(duì)接步驟求助(附圖）
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 用AutoDock對(duì)接的結(jié)合能較小，可能是什么原因？
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 用AutoDock作分子對(duì)接前的小分子能量最小化問題
已經(jīng)有6人回復(fù)
- Autodock對(duì)接構(gòu)象有問題，請(qǐng)教
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 【求助】Autodock用于虛擬篩選
已經(jīng)有21人回復(fù)
- 【求助】求助：怎樣將Autodock做出來的對(duì)接圖保存成pdb格式？謝謝
已經(jīng)有12人回復(fù)
- 【求助】autodock對(duì)接后小分子被打斷的情況
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 【求助】能夠計(jì)算結(jié)合自由能的分子對(duì)接軟件除了autodock還有哪些？
已經(jīng)有7人回復(fù)
916756502
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 177.5
- 帖子: 20
- 在線: 5.7小時(shí)
- 蟲號(hào): 3427573
- 注冊(cè): 2014-09-19
- 專業(yè): 化學(xué)生物學(xué)與生物有機(jī)化學(xué)
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
木頭珊瑚: 金幣+5, ★★★★★最佳答案 2014-10-30 04:42:19
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
木頭珊瑚: 金幣+5, ★★★★★最佳答案 2014-10-30 04:42:19
| 我也是新手，你去下載個(gè)Ultraedit吧，看pdb和psf挺好的。我覺得你做對(duì)接看中文AUTODOCK就很好，我把文件傳給你，你看看吧，我做的糖和蛋白質(zhì)的，結(jié)果挺好的，倒是沒看到過你說的那個(gè)文件。 |
» 本帖附件資源列表
-
歡迎監(jiān)督和反饋：小木蟲僅提供交流平臺(tái)，不對(duì)該內(nèi)容負(fù)責(zé)。
本內(nèi)容由用戶自主發(fā)布，如果其內(nèi)容涉及到知識(shí)產(chǎn)權(quán)問題，其責(zé)任在于用戶本人，如對(duì)版權(quán)有異議，請(qǐng)聯(lián)系郵箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : AutoDock&ADT教程.7z
2014-10-29 10:06:51, 6.43 M
2樓2014-10-29 10:05:53
ivan000
木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 6 (幼兒園)
- 金幣: 3707.2
- 紅花: 2
- 帖子: 570
- 在線: 185小時(shí)
- 蟲號(hào): 1115394
- 注冊(cè): 2010-10-07
- 專業(yè): 環(huán)境化工
3樓2014-10-30 00:23:31
| 附上教程 對(duì)著教程搞就好了！ |
» 本帖附件資源列表
-
歡迎監(jiān)督和反饋：小木蟲僅提供交流平臺(tái)，不對(duì)該內(nèi)容負(fù)責(zé)。
本內(nèi)容由用戶自主發(fā)布，如果其內(nèi)容涉及到知識(shí)產(chǎn)權(quán)問題，其責(zé)任在于用戶本人，如對(duì)版權(quán)有異議，請(qǐng)聯(lián)系郵箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : autodocktutorial2.pdf
2014-10-30 11:09:51, 1.36 M
4樓2014-10-30 11:10:19
|
頂 [ 發(fā)自小木蟲客戶端 ] |
5樓2014-11-02 09:59:46
autodockytu 
捐助貴賓 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 46 (小學(xué)生)
- 金幣: 163.8
- 散金: 1021
- 紅花: 5
- 帖子: 201
- 在線: 39.1小時(shí)
- 蟲號(hào): 1792292
- 注冊(cè): 2012-05-03
- 性別: GG
- 專業(yè): 獸醫(yī)學(xué)
6樓2014-11-05 21:54:17
chendi1991
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 1352.5
- 帖子: 40
- 在線: 13.3小時(shí)
- 蟲號(hào): 2338332
- 注冊(cè): 2013-03-11
- 專業(yè): 合成藥物化學(xué)
7樓2015-02-22 14:56:14
藍(lán)洋飄雪
木蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 2455.2
- 散金: 14
- 紅花: 3
- 帖子: 230
- 在線: 41.3小時(shí)
- 蟲號(hào): 3581025
- 注冊(cè): 2014-12-07
- 性別: MM
- 專業(yè): 獸醫(yī)藥理學(xué)與毒理學(xué)
8樓2015-09-02 21:15:46
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 木頭珊瑚 的主題更新
| 8 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 一志愿西安交通大學(xué)材料工程專業(yè) 282分求調(diào)劑 +11 | 楓橋ZL 2026-03-18 | 13/650 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 306求調(diào)劑 +6 | chuanzhu川燭 2026-03-18 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 284求調(diào)劑 +5 | Zhao anqi 2026-03-22 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 306求調(diào)劑 +5 | 來好運(yùn)來來來 2026-03-22 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 324求調(diào)劑 +6 | lucky呀呀呀鴨 2026-03-20 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 260求調(diào)劑 +3 | 朱芷琳 2026-03-20 | 4/200 |
|
|
|
[考研]
 一志愿東華大學(xué)化學(xué)070300，求調(diào)劑
+6
|
2117205181 2026-03-21 | 7/350 |
|
|
|
[考研]
一志愿070300浙大化學(xué)358分，求調(diào)劑！
+3
|
酥酥魚.. 2026-03-21 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 280求調(diào)劑 +11 | 咕嚕曉曉 2026-03-18 | 12/600 |
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +3 | 13341 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 330求調(diào)劑0854 +3 | assdll 2026-03-21 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 307求調(diào)劑 +3 | wyyyqx 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 294求調(diào)劑材料與化工專碩 +15 | 陌の森林 2026-03-18 | 15/750 |
|
|
|
[考研] 一志愿西安交通大學(xué) 學(xué)碩 354求調(diào)劑211或者雙一流 +3 | 我想要讀研究生 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 材料與化工專碩調(diào)劑 +7 | heming3743 2026-03-16 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 288求調(diào)劑，一志愿華南理工大學(xué)071005 +5 | ioodiiij 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 085601材料工程專碩求調(diào)劑 +10 | 慕寒mio 2026-03-16 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 +5 | pupcoco 2026-03-17 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 材料，紡織，生物（0856、0710），化學(xué)招生啦 +3 | Eember. 2026-03-17 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 一志愿蘇州大學(xué)材料工程（085601）專碩有科研經(jīng)歷三項(xiàng)國(guó)獎(jiǎng)兩個(gè)實(shí)用型專利一項(xiàng)省級(jí)立項(xiàng) +6 | 大火山小火山 2026-03-16 | 8/400 |
|