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PNAS-向沉默基因巧要藥源分子-南京大學(xué)譚仁祥教授 已有15人參與
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生物可產(chǎn)生結(jié)構(gòu)出乎人類想象的有機化合物(俗稱“天然產(chǎn)物”),其中不乏像青蒿素、青霉素、紫杉醇等寶貴的藥物分子,F(xiàn)代基因組學(xué)研究預(yù)示著許多微生物的生物合成基因在常規(guī)實驗室培養(yǎng)條件下處于沉默狀態(tài),設(shè)法激活這些沉默基因?qū)瓉硖烊划a(chǎn)物化學(xué)研究的新浪潮,但可對沉默基因激活的方法求之難得。針對這一難題,南京大學(xué)醫(yī)藥生物技術(shù)國家重點實驗室譚仁祥教授課題組率先借助皮氏反應(yīng)(Pictet–Spengler reaction)規(guī)律,在共生菌天然產(chǎn)物研究方面取得新重要進展,題為“Pictet–Spengler reaction based biosynthetic machinery in fungi(http://www.pnas.org/content/early/2014/11/24/1417304111)”的重要成果最近在線發(fā)表在《美國科學(xué)院院報》(Proceedings of the National Academy of the Sciences of the United States of America,縮寫PNAS)上。論文第一作者為嚴威、戈惠明、王剛和蔣南,通訊作者為譚仁祥教授。 在自然界處于“弱勢”的微生物和植物需合成結(jié)構(gòu)特殊的有機分子來調(diào)節(jié)其自身生長發(fā)育和對生態(tài)環(huán)境的巧妙適應(yīng),故天然產(chǎn)物往往具有顯著的生物活性。據(jù)統(tǒng)計,全球上市的藥物中半數(shù)以上基于天然產(chǎn)物及其特有結(jié)構(gòu)單元。在某些植物中,異胡豆苷酶(strictosidine synthase)催化形成嗎啡(morphine,鎮(zhèn)痛藥)、喜樹堿(camptothecin,抗癌藥)、利血平(reserpine,降血壓藥)等結(jié)構(gòu)和功能都較多樣的藥物分子,但至今尚未發(fā)現(xiàn)任何基于皮氏反應(yīng)的真菌分子!該研究組采用生物信息學(xué)分析方法發(fā)現(xiàn)了毛殼菌(Chaetomium globosum)具有編碼功能類似于異胡豆苷酶的基因,但該真菌在多種實驗條件下就是不產(chǎn)生基于皮氏反應(yīng)的天然產(chǎn)物,這表明該編碼基因在那些培養(yǎng)條件下表達極低或根本不表達。于是,該課題組篩選了多種化合物,發(fā)現(xiàn)1-甲基色氨酸可先上調(diào)該編碼基因的表達5倍以上,然后再在誘導(dǎo)表達出的真菌皮氏反應(yīng)酶(fungal Pictet–Spenglerase)的催化下與該真菌合成的芳香醛(flavipin)發(fā)生皮氏反應(yīng),產(chǎn)生的皮氏反應(yīng)產(chǎn)物隨即又在多種氧化酶的參與下形成了一系列骨架全新的生物堿。此后,該課題對這些新生物堿進行活性評價,發(fā)現(xiàn)其中兩個生物堿的抗菌活性超過臨床用藥(替硝唑),為新型抗菌藥的研發(fā)提供新的重要線索;另還發(fā)現(xiàn)一個新生物堿具有顯著的乙酰膽堿酯酶抑制作用,可用作開發(fā)抗老年癡呆癥藥物的起始分子。最后,為詮釋這些全新重要分子的生物合成途徑,該團隊發(fā)展了“基因提示下的酶抑制方法”(gene-implied enzyme inhibition, GIEI),此策略再與同位素標記實驗組合,成功繪制出這些生物堿的生物合成組裝路線圖,從而整個研究工作具有“讓啞巴唱歌”之妙。此工作預(yù)計會對天然產(chǎn)物研究領(lǐng)域發(fā)揮示范和引領(lǐng)作用。 南京大學(xué)譚仁祥教授在植物活性成分研究方面的成果卓著,有關(guān)成果于2009年獲國家自然科學(xué)獎二等獎。他適時地將數(shù)年的國外留學(xué)所學(xué)和獨到的植物化學(xué)研究經(jīng)驗理念成功地延伸至共生菌活性物質(zhì)的研究,并取得了國際認可的成果,部分成果于2007年獲英國皇家化學(xué)會“RSC Natural Product Reports Award”(迄今唯一亞洲獲獎?wù)撸。近年來,譚仁祥教授在共生菌產(chǎn)生的重要天然產(chǎn)物研究方面取得了一系列研究成果,以譚教授為學(xué)術(shù)帶頭人的“天然藥源分子及其作用特點”創(chuàng)新研究群體連續(xù)兩次獲得國家自然基金委的滾動支持,在《Nat. Commun.》、《Angew. Chem. Int. Ed.》、《J. Am. Chem. Soc.》、《Nat. Prod. Rep.》等國際著名刊物上發(fā)表了高水平論文,在國內(nèi)外產(chǎn)生了較大影響,為我國天然產(chǎn)物化學(xué)領(lǐng)域步入國際先進行列做出了重要貢獻。(南京大學(xué) 陳曉清) 圖1. 激活真菌沉默基因、引發(fā)皮氏反應(yīng)(Pictet–Spengler reaction). (A) 基于皮氏反應(yīng)的典型植物成分. (B) 1-甲基色氨酸既能上調(diào)皮氏反應(yīng)酶(Pictet–Spenglerase)的基因表達,又可在此酶催化下與真菌產(chǎn)生的醛(flavipin)反應(yīng)形成骨架全新的生物堿;其中chaetogline B和F 具有顯著抗菌活性,且后者還具有乙酰膽堿酯酶抑制活性,為當今急需新抗菌藥和抗老年癡呆藥的創(chuàng)制提供嶄新源頭分子。 轉(zhuǎn)自 http://news.sciencenet.cn/htmlpaper/2014112810503254935067.shtm |
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