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hunterbleach新蟲 (初入文壇)
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[求助]
ms cestep優(yōu)化問題
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各位老師,我想建一個(gè)有機(jī)物在水溶液中吸附到金屬表面的模型,我打算這樣(剛?cè)腴T四天,錯(cuò)誤疊出,有些地方不知道怎么描述,直接用軟件中的詞來描述) 1.建金屬的晶胞,優(yōu)化,再能量最小化 2建有機(jī)分子,優(yōu)化,能量最小化后粘貼到金屬表面真空 3建水盒子 4build layer到金屬表面 整個(gè)過程對嗎?還有就是我在有機(jī)分子優(yōu)化時(shí),出了問題,教程中是用co吸附到pt表面為例,在晶胞內(nèi)直接add atoms,但是我這個(gè)有機(jī)物太復(fù)雜了,我是自己在ms中畫出來,重拍后,直接粘貼移動到一個(gè)晶胞里的,這樣可行嗎?在準(zhǔn)備CESTEP 優(yōu)化時(shí),發(fā)現(xiàn)一只優(yōu)化不了,是因?yàn)榉肿犹珡?fù)雜了嗎?就是一個(gè)82原子的有機(jī)物而已啊。 我之前的過程是把水和有機(jī)物放到一個(gè)盒子里,再弛豫,build layer到金屬表面,跑完后發(fā)現(xiàn)有機(jī)物還是在水中,并未跑到金屬表面去啊。 希望能得到各位老師指導(dǎo)吧 |
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