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讓她降落銅蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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關(guān)于16SrDNA文庫(kù)的一些疑問(wèn) 已有1人參與
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| 通過(guò)建立 16SrDNA文庫(kù)能夠分析細(xì)菌菌落結(jié)構(gòu)，并能篩選出優(yōu)勢(shì)菌種。那么利用這種手段能否分析某種因素對(duì)某種細(xì)菌含量的作用。例如，能否用這種方法分析因素A對(duì)某地區(qū)中細(xì)菌B數(shù)量的影響（剔除A和加入A后細(xì)菌數(shù)量B的變化對(duì)比，假設(shè)細(xì)菌B不可被培養(yǎng)）。樓主看到一篇文獻(xiàn)上說(shuō)這種方法可以通過(guò)16SrDNA克隆數(shù)來(lái)反映對(duì)細(xì)菌數(shù)量的影響，但樓主的疑惑是建立16SrDNA文庫(kù)不是需要擴(kuò)增嗎？擴(kuò)增后克隆數(shù)還能與原菌落原克隆數(shù)相對(duì)應(yīng)嗎？ |
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可以的，但類(lèi)似克隆文庫(kù)、DGGE、T-RFLP的方法研究物種的多樣性往往比較粗略，只能大體知道某個(gè)物種的豐度。如果想精確定量，用Q-pcr等方式吧。 你提取出來(lái)的是環(huán)境樣品中的總DNA，PCR擴(kuò)增之后是將所有的細(xì)菌都進(jìn)行可擴(kuò)增，還是能反應(yīng)某一物種在整個(gè)環(huán)境中的大致比例的。 |
3樓2014-12-22 08:21:57
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5樓2014-12-23 09:51:55
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