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讓她降落銅蟲 (正式寫手)
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關(guān)于16SrDNA文庫的一些疑問 已有1人參與
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| 通過建立 16SrDNA文庫能夠分析細菌菌落結(jié)構(gòu)，并能篩選出優(yōu)勢菌種。那么利用這種手段能否分析某種因素對某種細菌含量的作用。例如，能否用這種方法分析因素A對某地區(qū)中細菌B數(shù)量的影響（剔除A和加入A后細菌數(shù)量B的變化對比，假設(shè)細菌B不可被培養(yǎng)）。樓主看到一篇文獻上說這種方法可以通過16SrDNA克隆數(shù)來反映對細菌數(shù)量的影響，但樓主的疑惑是建立16SrDNA文庫不是需要擴增嗎？擴增后克隆數(shù)還能與原菌落原克隆數(shù)相對應(yīng)嗎？ |
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可以的，但類似克隆文庫、DGGE、T-RFLP的方法研究物種的多樣性往往比較粗略，只能大體知道某個物種的豐度。如果想精確定量，用Q-pcr等方式吧。 你提取出來的是環(huán)境樣品中的總DNA，PCR擴增之后是將所有的細菌都進行可擴增，還是能反應(yīng)某一物種在整個環(huán)境中的大致比例的。 |
3樓2014-12-22 08:21:57
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4樓2014-12-22 09:34:26
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5樓2014-12-23 09:51:55
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