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讓她降落銅蟲 (正式寫手)
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[求助]
關(guān)于16SrDNA文庫的一些疑問 已有1人參與
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| 通過建立 16SrDNA文庫能夠分析細(xì)菌菌落結(jié)構(gòu),并能篩選出優(yōu)勢菌種。那么利用這種手段能否分析某種因素對某種細(xì)菌含量的作用。例如,能否用這種方法分析因素A對某地區(qū)中細(xì)菌B數(shù)量的影響(剔除A和加入A后細(xì)菌數(shù)量B的變化對比,假設(shè)細(xì)菌B不可被培養(yǎng))。樓主看到一篇文獻(xiàn)上說這種方法可以通過16SrDNA克隆數(shù)來反映對細(xì)菌數(shù)量的影響,但樓主的疑惑是建立16SrDNA文庫不是需要擴增嗎?擴增后克隆數(shù)還能與原菌落原克隆數(shù)相對應(yīng)嗎? |
分子生物 |
木蟲 (小有名氣)
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可以的,但類似克隆文庫、DGGE、T-RFLP的方法研究物種的多樣性往往比較粗略,只能大體知道某個物種的豐度。如果想精確定量,用Q-pcr等方式吧。 你提取出來的是環(huán)境樣品中的總DNA,PCR擴增之后是將所有的細(xì)菌都進(jìn)行可擴增,還是能反應(yīng)某一物種在整個環(huán)境中的大致比例的。 |
銅蟲 (正式寫手)
銅蟲 (正式寫手)
木蟲 (小有名氣)
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