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阿南hmily

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[求助] 關(guān)于在NCBI上BLAST的結(jié)果分析已有2人參與

最近在NCBI上將一株噬菌體和一株大腸桿菌序列進(jìn)行了比對(duì)，出現(xiàn)了圖中所示的結(jié)果，請(qǐng)問(wèn)是什么意思？我該怎么分析呢？求大俠指教！

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1樓 2014-12-22 10:39:50

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liuderong

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這是以圖形的形式展示比對(duì)結(jié)果，頁(yè)面往下拉就可以看到序列匹配結(jié)果。你的序列好長(zhǎng)，估計(jì)是網(wǎng)站顯示不出來(lái)，或者要加載很長(zhǎng)時(shí)間，你沒(méi)等加載完就關(guān)閉頁(yè)面了。你可以拿兩個(gè)短一點(diǎn)的序列blast，一看就明白了。

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3樓2014-12-22 11:55:28

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fangbeibei99

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是不是比對(duì)的方法不對(duì)�。蓚€(gè)序列的比對(duì)結(jié)果怎么會(huì)是這樣的！

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微信公眾號(hào)BioHook學(xué)生物就是這么任性

2樓2014-12-22 11:35:23

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引用回帖:

3樓: Originally posted by liuderong at 2014-12-22 11:55:28
這是以圖形的形式展示比對(duì)結(jié)果，頁(yè)面往下拉就可以看到序列匹配結(jié)果。你的序列好長(zhǎng)，估計(jì)是網(wǎng)站顯示不出來(lái)，或者要加載很長(zhǎng)時(shí)間，你沒(méi)等加載完就關(guān)閉頁(yè)面了。你可以拿兩個(gè)短一點(diǎn)的序列blast，一看就明白了。

我想將我剛測(cè)序的一株噬菌體和宿主菌的序列進(jìn)行BLAST比對(duì)，那么進(jìn)入下面的界面中，哪里添加噬菌體序列，哪里添加宿主菌序列？我標(biāo)記出來(lái)的地方該怎么選擇參數(shù)呢？
請(qǐng)指教�。∈指兄x��！

360截圖20141222165605906.jpg

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4樓2014-12-22 17:00:56

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阿南hmily: 金幣+5, ★★★很有幫助 2014-12-22 21:32:15

兩條已知序列比對(duì)不是在這個(gè)網(wǎng)站頁(yè)面的，要到這里http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... ;LINK_LOC=align2seq，里頭有兩個(gè)框，把你的兩條序列放進(jìn)去比對(duì)就行。那條序列放哪個(gè)框都不要緊的。

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5樓2014-12-22 20:03:35

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