 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 查看: 2257 | 回復(fù): 15 | |||
趙紅霞鐵桿木蟲 (著名寫手)
|
[求助]
分子模擬中剛?cè)嵝院陀H水性怎么表示 已有2人參與
|
||
|
如題，在聚合物鏈中，由于主鏈上是否還帶其它基團（如甲基）對宏觀性能影響很大，現(xiàn)在只能猜測是這兩個因素， 一個是鏈的剛?cè)嵝圆灰粯�，另一個是鏈的親水性不一樣，想通過分子模擬來求證，可是要怎么表征呢？ 請大俠指點，金幣好說 |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
275求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
招08考數(shù)學(xué)
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
303求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
306求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
考研調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
285求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
一志愿北京化工大學(xué)070300 學(xué)碩336求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
318求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- autodock柔性對接缺少MAP文件相關(guān)問題
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 求助親水性偶聯(lián)劑有沒有？
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 怎么使得疏水性基底變得親水？
已經(jīng)有9人回復(fù)
- autodock柔性對接
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 如何使高分子微球或者納米球變?yōu)橛H水性的？
已經(jīng)有19人回復(fù)
- 急~~~~~~~~如何提高聚碳酸酯表面親水性~~~~~~~~~~~~~~~~
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 蛋白質(zhì)同源模建求助！
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 有關(guān)PEGDA和PDMS的親水性判斷方法
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 那位知道如何脫去親水性高分子中的水分？
已經(jīng)有14人回復(fù)
- 如何提高zsm-5分子篩的親水性
已經(jīng)有21人回復(fù)
- 求助：具有靶向作用的親水性大分子
已經(jīng)有15人回復(fù)
- 如何測高分子的親水性?
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 請問以下親水性高分子有哪些溶于DMF，并且誰的力學(xué)性能最好？
已經(jīng)有13人回復(fù)
- 【求助】有關(guān)PDMS的親水性
已經(jīng)有13人回復(fù)
- 【求助】常見的親水性高分子有哪些？
已經(jīng)有21人回復(fù)
- 【求助】關(guān)于蛋白或者氨基酸柔性問題
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 【求助】多巴胺膜親水性改性遇到的問題！��！
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 【求助】求助親水性固化劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 【求助】柔性模型怎么定義
已經(jīng)有6人回復(fù)
ktwyw
木蟲 (小有名氣)
- 模擬EPI: 1
- 應(yīng)助: 11 (小學(xué)生)
- 金幣: 2727.6
- 散金: 500
- 紅花: 41
- 帖子: 162
- 在線: 114.6小時
- 蟲號: 143500
- 注冊: 2005-12-22
- 專業(yè): 高分子物理與高分子物理化
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
趙紅霞: 金幣+20, ★★★★★最佳答案 2014-12-26 14:27:44
趙紅霞: 金幣+20, ★★★★★最佳答案 2014-12-26 14:27:44
|
關(guān)于在分子模擬里表征高分子鏈的柔順性，你可考慮去計算 （1）二面角內(nèi)旋轉(zhuǎn)位能曲線，這一點fanc232已經(jīng)提到了，表征鏈的靜態(tài)柔順性的重要參數(shù)是旁式與反式的勢能位壘，位壘越低，鏈越柔順； （2）計算鏈的末端距與聚合度的關(guān)系，然后構(gòu)建高斯等效鏈段模型，由此可以得到Flory特征比或者Kuhn鏈段長度，這兩個值越小，鏈越柔順； （3）計算鍵取向的相關(guān)函數(shù)(correlation function of bond orientation), 相關(guān)函數(shù)衰減的越快，鏈越柔順。根據(jù)相關(guān)函數(shù)的衰減你可以可以得到鏈的持久長度，持久長度越小，鏈越柔順。 關(guān)于在分子模擬里表征鏈的水溶性，你可以考慮去計算聚合物和水各自的Hildebrand溶度參數(shù)（solubility parameter）(注：其實這些對于常見高分子，你查表也可以查得到），然后得到Flory-Huggin Chi-parameter, chi值越小，說明聚合物的水溶性與好。 聚合物和蛋白還是不太一樣，我個人覺得fanc232提出的方案可能行不通。 另外，就你給的兩個分子，看上去柔順性和水溶性應(yīng)該都是PAA要比PCA好一點吧，你想通過分子模擬證實這一點么？ |
10樓2014-12-26 14:03:37
趙紅霞
鐵桿木蟲 (著名寫手)
- 應(yīng)助: 73 (初中生)
- 金幣: 6197.9
- 散金: 141
- 紅花: 33
- 帖子: 1541
- 在線: 700小時
- 蟲號: 1544094
- 注冊: 2011-12-20
- 性別: MM
- 專業(yè): 理論和計算化學(xué)
2樓2014-12-25 18:25:53
ktwyw
木蟲 (小有名氣)
- 模擬EPI: 1
- 應(yīng)助: 11 (小學(xué)生)
- 金幣: 2727.6
- 散金: 500
- 紅花: 41
- 帖子: 162
- 在線: 114.6小時
- 蟲號: 143500
- 注冊: 2005-12-22
- 專業(yè): 高分子物理與高分子物理化
3樓2014-12-25 18:46:12
趙紅霞
鐵桿木蟲 (著名寫手)
- 應(yīng)助: 73 (初中生)
- 金幣: 6197.9
- 散金: 141
- 紅花: 33
- 帖子: 1541
- 在線: 700小時
- 蟲號: 1544094
- 注冊: 2011-12-20
- 性別: MM
- 專業(yè): 理論和計算化學(xué)
4樓2014-12-25 19:00:17
趙紅霞
鐵桿木蟲 (著名寫手)
- 應(yīng)助: 73 (初中生)
- 金幣: 6197.9
- 散金: 141
- 紅花: 33
- 帖子: 1541
- 在線: 700小時
- 蟲號: 1544094
- 注冊: 2011-12-20
- 性別: MM
- 專業(yè): 理論和計算化學(xué)
5樓2014-12-25 19:01:54
fanc232
新蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 8 (幼兒園)
- 金幣: 1238.4
- 散金: 206
- 紅花: 3
- 帖子: 253
- 在線: 108.7小時
- 蟲號: 1046781
- 注冊: 2010-06-24
- 性別: MM
- 專業(yè): 細胞生物學(xué)研究中的新方法
【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
|
親水性疏水性，你把沒加甲基的體系，和加了甲基的體系，分別放在溶劑里做個比較徹底的能量最小化，找到它在溶劑里最可能的構(gòu)象，然后分別測一下暴露在溶劑中的親水性基團和疏水基團的面積，做個比例，二者比較一下大小。 剛?cè)嵝裕阒傅氖�，加入甲基引進了空間位阻和其它作用力，有沒有影響鏈的構(gòu)象變化吧。要不你試試在鏈上選幾個重要的可旋轉(zhuǎn)鍵形成的二面角，看看在分子模擬過程中，二面角的范圍有沒有變狹窄，如果是，那估計就是剛性增加柔性減弱了。 NOTE�。∥覜]做過那么多分子動力學(xué)模擬，這就是我一個想法而已，你再跟其他人多商量商量再確定吧。 |
6樓2014-12-26 09:01:43
pigrass
專家顧問 (著名寫手)
伊卡斯特的小豬
-
專家經(jīng)驗: +503 - 模擬EPI: 4
- 應(yīng)助: 377 (碩士)
- 金幣: 10371
- 散金: 3286
- 紅花: 166
- 帖子: 2101
- 在線: 1968.4小時
- 蟲號: 1463681
- 注冊: 2011-10-27
- 性別: GG
- 專業(yè): 高分子材料結(jié)構(gòu)與性能
- 管轄: 分子模擬
7樓2014-12-26 09:16:50
趙紅霞
鐵桿木蟲 (著名寫手)
- 應(yīng)助: 73 (初中生)
- 金幣: 6197.9
- 散金: 141
- 紅花: 33
- 帖子: 1541
- 在線: 700小時
- 蟲號: 1544094
- 注冊: 2011-12-20
- 性別: MM
- 專業(yè): 理論和計算化學(xué)
8樓2014-12-26 09:39:13
fanc232
新蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 8 (幼兒園)
- 金幣: 1238.4
- 散金: 206
- 紅花: 3
- 帖子: 253
- 在線: 108.7小時
- 蟲號: 1046781
- 注冊: 2010-06-24
- 性別: MM
- 專業(yè): 細胞生物學(xué)研究中的新方法
|
您好，我是生物背景的，而且經(jīng)驗不多，很抱歉在解答您問題的時候沒有跳出我自己的思維圈子。 1.我一直認為長鏈化合物放在溶劑里，跟溶劑親和的部位傾向于暴露在外，跟溶劑排斥的部位傾向于互相聚合，被包裹在內(nèi)。就跟蛋白質(zhì)折疊似的。所以我不認為所有原子或基團都暴露在溶液中，除非聚合物的鏈很短。 2.關(guān)于基團的親水面積和疏水面積，我只知道肯定有軟件可以自動計算，比如schrodinger、SYBYL、Discovery Studio之類，這些是我自己常用的分子編輯軟件。樓主可以翻翻自己常用的分子編輯軟件的說明書，找找這個功能應(yīng)該怎么用。 |
9樓2014-12-26 10:46:23
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 Andsharia 的主題更新
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 285求調(diào)劑 +6 | ytter 2026-03-22 | 6/300 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 考研化學(xué)學(xué)碩調(diào)劑，一志愿985 +5 | 張vvvv 2026-03-15 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 材料與化工（0856）304求B區(qū)調(diào)劑 +3 | 邱gl 2026-03-20 | 7/350 |
|
|
[考研] 一志愿南大，0703化學(xué)，分數(shù)336，求調(diào)劑 +3 | 收到VS 2026-03-21 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 +4 | 妮妮ninicgb 2026-03-21 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 317求調(diào)劑 +9 | 申子申申 2026-03-19 | 15/750 |
|
|
|
[考研] 306求0703調(diào)劑一志愿華中師范 +5 | 紙魚ly 2026-03-21 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 0805材料320求調(diào)劑 +3 | 深海物語 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 材料與化工（0856）304求 B區(qū) 調(diào)劑 +3 | 邱gl 2026-03-21 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 083200學(xué)碩321分一志愿暨南大學(xué)求調(diào)劑 +3 | innocenceF 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 化學(xué)求調(diào)劑 +4 | 臨澤境llllll 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 考研調(diào)劑求學(xué)校推薦 +3 | 伯樂29 2026-03-18 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿 西北大學(xué) ，070300化學(xué)學(xué)碩，總分287，雙非一本，求調(diào)劑。 +4 | 晨昏線與星海 2026-03-19 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 290求調(diào)劑 +7 | ^O^乜 2026-03-19 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 一志愿華中農(nóng)業(yè)071010，總分320求調(diào)劑 +3 | 困困困困坤坤 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 295材料求調(diào)劑，一志愿武漢理工085601專碩 +5 | Charlieyq 2026-03-19 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿西安交通大學(xué) 學(xué)碩 354求調(diào)劑211或者雙一流 +3 | 我想要讀研究生 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 086500 325 求調(diào)劑 +3 | 領(lǐng)帶小熊 2026-03-19 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 材料專碩306英一數(shù)二 +10 | z1z2z3879 2026-03-16 | 13/650 |
|
|
|
[考研] 326求調(diào)劑 +5 | 上岸的小葡 2026-03-15 | 6/300 |
|