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小范范1989木蟲 (著名寫手)
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[交流]
優(yōu)化s1的結(jié)構(gòu)，實在是優(yōu)化不出來。能不能幫助解答一下，或者是優(yōu)化一下也行，謝謝了
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輸入文件和輸出文件我貼出來。 一直是調(diào)大nstates，但是不行，都到40了 我想優(yōu)化4個分子，我這只給出了第四個的錯誤。 |
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| 優(yōu)化過程中第一激發(fā)態(tài)先變成第二激發(fā)態(tài)，然后變得更高，Gaussian找不到這個態(tài)，就出現(xiàn)“No map to state”的問題。如果你只關(guān)心這個態(tài)，不管能量有多高，那么就繼續(xù)增加nstates，否則就在出錯的結(jié)構(gòu)優(yōu)化新的root 1（或其它態(tài)）。 |
2樓2014-12-26 23:41:54
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4樓2014-12-27 09:52:28
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5樓2014-12-27 11:27:38
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1、log文件中有Would need an additional608504000000 words for in-memory AO integral storage.也就是說，你想要用direct，需要至少4.5TB的內(nèi)存，這是不可能完成的任務(wù)，顯然系統(tǒng)忽略了你這一要求。 2、任何優(yōu)化都是基于一個合理的結(jié)構(gòu)初始猜，還是先核對一下你的初始結(jié)構(gòu)吧。比如，中間那個六取代的氫化均三嗪，為什么是船式構(gòu)象而不是椅式構(gòu)象，這個結(jié)構(gòu)有單晶數(shù)據(jù)么？H48-H108是否太過靠近？那個C86是怎么雜化的？怎么那么奇葩？ 基于一個不可能的假設(shè)結(jié)構(gòu)，別說去優(yōu)化激發(fā)態(tài)，就是優(yōu)化基態(tài)都是不可行的。 |
6樓2014-12-29 08:06:29
小范范1989
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9樓2015-01-01 19:29:07
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沒事，我當初比你知道的還少，問的問題更傻，這不也挺過來了�，F(xiàn)在正在接觸幾個不同領(lǐng)域，都還沒入門呢，想問問題都不知道該問啥。。 自己設(shè)想或者改造分子結(jié)構(gòu)是沒問題的，這不就是計算化學(xué)相比實驗的優(yōu)勢么。但結(jié)構(gòu)要盡量符合化學(xué)經(jīng)驗，比如常見的鍵長，鍵角，二面角等限制因素。你目前這個要重新調(diào)整構(gòu)象，然后做優(yōu)化。等優(yōu)化成功了，再考慮計算光譜，不過這個分子結(jié)構(gòu)不小，算起來有些花費時間。如果只是練習(xí)，不需要搞這么大的體系。 [ 發(fā)自小木蟲客戶端 ] |
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小范范198910樓2015-01-02 00:34:04
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