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maoxixi新蟲 (初入文壇)
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[求助]
如何將細(xì)菌全基因組序列翻譯成蛋白 已有3人參與
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| 如何將全基因組的dna序列翻譯成蛋白，或者有哪個(gè)網(wǎng)站的翻譯結(jié)果可信度較高？ |
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zshw_001
金蟲 (小有名氣)
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4樓2015-01-23 17:57:51
liuderong
鐵桿木蟲 (正式寫手)
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【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
| 將DNA翻譯成蛋白質(zhì)比較簡(jiǎn)單，很多軟件都可以實(shí)現(xiàn)，一個(gè)密碼子對(duì)應(yīng)一個(gè)氨基酸，一般情況不會(huì)有錯(cuò)，只是翻譯出來(lái)的結(jié)果沒(méi)有什么用。細(xì)菌基因組里有很多區(qū)域本來(lái)就不是用來(lái)翻譯蛋白的，全基因組翻譯可能會(huì)造成移碼，中途碰到終止子也很普遍，得到的蛋白根本沒(méi)有用。如果你要找某個(gè)細(xì)菌的某種蛋白，而有沒(méi)有參考序列，建議你使用blastX。 |
2樓2015-01-23 09:17:49
chenguestc
木蟲 (職業(yè)作家)
- BioEPI: 1
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【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
| 輸入你的序列到 http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... ;LINK_LOC=blasthome 對(duì)話框中，點(diǎn)BLAST |
3樓2015-01-23 13:57:52
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