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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 生物醫(yī)藥區(qū) » 微生物 » 實驗/技術 » 細菌蛋白酶序列
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luocongqiang鐵蟲 (小有名氣)
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[求助]
細菌蛋白酶序列
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| 想問一下大家，不同細菌編碼蛋白酶的基因序列是否相同或是差異有多大，是否不同細菌有共同的保守序列。謝謝 |
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【答案】應助回帖
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luocongqiang: 金幣+40 2013-05-21 10:35:28
laozuzunzhe: 金幣+3, MicEPI+1, good！ 2013-05-21 15:15:36
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laozuzunzhe: 金幣+3, MicEPI+1, good！ 2013-05-21 15:15:36
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后邊那個也叫同原序列吧？！？！ 不同菌種產生的蛋白酶類有很多區(qū)別，特別是基因序列很小的變化可以改變蛋白酶的很多性質， 所以從天然的樣品中分離和篩選新的菌種和其產生的蛋白酶類這一方面有很多人在研究。 舉個例子： CC2菌是經(jīng)細菌16SRNA基因序列分析證明的一種枯草芽孢桿菌,根據(jù)納豆激酶基因序列設計引和PCR擴增得到與納豆激酶基因非常相似的基因,GenBankBLAST分析表明CC2菌蛋白酶基因與枯草芽孢桿菌YF038納豆激酶基因序列僅有2個核苷酸差別,兩者均產生編碼的氨基酸變化;而與枯草芽孢桿菌DTQ2DR23蛋白酶基因比較有3個核苷酸差別,但是僅有1個編碼的氨基酸變化,因此CC2菌的蛋白酶基因編碼的蛋白質與DTQ2DR23蛋白酶最相似。GenBankBLAST搜索分析發(fā)現(xiàn)與CC2菌蛋白酶基因相似的序列很多,但是其他序列均有2個以上氨基酸的差別。CC2菌蛋白酶基因產生的突變是否影響到蛋白酶性質的變化,需要進一步研究蛋白酶的活性等性質�？莶菅挎邨U菌是自然界變異很快的細菌。因此菌體編碼的基因序列也在不斷的變化,所以從天然樣品中分離菌種,克隆相關的基因,獲得更多的基因信息非常有意義，自然也就成為業(yè)內研究熱點。 |
2樓2013-05-20 20:52:11
志子
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3樓2013-05-20 20:57:31
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4樓2013-05-21 10:35:19
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