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luocongqiang鐵蟲 (小有名氣)
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[求助]
細(xì)菌蛋白酶序列
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| 想問一下大家，不同細(xì)菌編碼蛋白酶的基因序列是否相同或是差異有多大，是否不同細(xì)菌有共同的保守序列。謝謝 |
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志子
至尊木蟲 (文壇精英)
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
luocongqiang: 金幣+40 2013-05-21 10:35:28
laozuzunzhe: 金幣+3, MicEPI+1, good！ 2013-05-21 15:15:36
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
luocongqiang: 金幣+40 2013-05-21 10:35:28
laozuzunzhe: 金幣+3, MicEPI+1, good！ 2013-05-21 15:15:36
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后邊那個也叫同原序列吧？�。�！ 不同菌種產(chǎn)生的蛋白酶類有很多區(qū)別，特別是基因序列很小的變化可以改變蛋白酶的很多性質(zhì)， 所以從天然的樣品中分離和篩選新的菌種和其產(chǎn)生的蛋白酶類這一方面有很多人在研究。 舉個例子： CC2菌是經(jīng)細(xì)菌16SRNA基因序列分析證明的一種枯草芽孢桿菌,根據(jù)納豆激酶基因序列設(shè)計引和PCR擴(kuò)增得到與納豆激酶基因非常相似的基因,GenBankBLAST分析表明CC2菌蛋白酶基因與枯草芽孢桿菌YF038納豆激酶基因序列僅有2個核苷酸差別,兩者均產(chǎn)生編碼的氨基酸變化;而與枯草芽孢桿菌DTQ2DR23蛋白酶基因比較有3個核苷酸差別,但是僅有1個編碼的氨基酸變化,因此CC2菌的蛋白酶基因編碼的蛋白質(zhì)與DTQ2DR23蛋白酶最相似。GenBankBLAST搜索分析發(fā)現(xiàn)與CC2菌蛋白酶基因相似的序列很多,但是其他序列均有2個以上氨基酸的差別。CC2菌蛋白酶基因產(chǎn)生的突變是否影響到蛋白酶性質(zhì)的變化,需要進(jìn)一步研究蛋白酶的活性等性質(zhì)。枯草芽孢桿菌是自然界變異很快的細(xì)菌。因此菌體編碼的基因序列也在不斷的變化,所以從天然樣品中分離菌種,克隆相關(guān)的基因,獲得更多的基因信息非常有意義，自然也就成為業(yè)內(nèi)研究熱點(diǎn)。 |
2樓2013-05-20 20:52:11
志子
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3樓2013-05-20 20:57:31
luocongqiang
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4樓2013-05-21 10:35:19
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