 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 4 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 2206 | 回復: 3 | ||
feiye2214木蟲 (正式寫手)
|
[求助]
關(guān)于DNASP軟件設(shè)置including gaps，插入位點導致新單倍型產(chǎn)生
|
|
分析群體數(shù)據(jù)時發(fā)現(xiàn)問題了，希望有人幫我看看怎么解決。 一組DNA序列，其中有幾個序列因為插入突變導致一個新的單倍型出現(xiàn)，目前的單倍型H2和H3之間就是這個插入位點的差異，大致是這樣的: H1：ATGAATGCATGC--ATGCATGCATGCATGC H2：*************AT*************A**** H3：*************--**************A**** 我的問題是我在DNA polymorphism時總是缺失一個單倍型，軟件直接把H2、H3合并為一個單倍型了，就是說“excluded gaps”，而我想怎么設(shè)置才能“including gaps”? 如上圖所示，單倍型數(shù)量不一致，我要的Haplotype (gene) diversity, Hd Variance of Haplotype diversity Standard Deviation of Haplotype diversity都會不一樣。 我點擊上圖的這兩個設(shè)置，也沒有用，DNA polymorphism還是自動去除了gaps/missing 有人能幫我一下嗎？現(xiàn)在基本卡住了，沒法繼續(xù)分析了。 |
回復此樓» 猜你喜歡
321求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復
-
一志愿中海洋材料工程專碩330分求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復
-
一志愿天大材料與化工（085600）總分338
已經(jīng)有5人回復
-
288求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復
-
材料080500調(diào)劑求收留
已經(jīng)有4人回復
-
一志愿吉林大學材料學碩321求調(diào)劑
已經(jīng)有9人回復
-
294求調(diào)劑材料與化工專碩
已經(jīng)有8人回復
-
一志愿985，本科211，0817化學工程與技術(shù)319求調(diào)劑
已經(jīng)有10人回復
-
一志愿西安交通大學材料工程專業(yè) 282分求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復
-
332求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復
2樓2015-04-06 14:19:20
jcj723
木蟲 (初入文壇)
- 應助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 2756.9
- 紅花: 1
- 帖子: 29
- 在線: 256.6小時
- 蟲號: 1822043
- 注冊: 2012-05-17
- 性別: GG
- 專業(yè): 畜牧學與草地科學
3樓2015-04-08 21:34:39
4樓2018-07-27 00:55:37
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 feiye2214 的主題更新
| 4 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 321求調(diào)劑 +5 | 何潤采123 2026-03-18 | 5/250 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 294求調(diào)劑材料與化工專碩 +8 | 陌の森林 2026-03-18 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 267一志愿南京工業(yè)大學0817化工求調(diào)劑 +10 | SUICHILD 2026-03-12 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 285化工學碩求調(diào)劑（081700） +11 | 柴郡貓_ 2026-03-12 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 330求調(diào)劑 +3 | 小材化本科 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +12 | 小熊joy 2026-03-14 | 13/650 |
|
|
[基金申請] 被我言中：新模板不強調(diào)格式了，假專家開始管格式了 +4 | beefly 2026-03-14 | 4/200 |
|
|
|
[論文投稿] 有沒有大佬發(fā)小論文能帶我個二作 +3 | 增銳漏人 2026-03-17 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 283求調(diào)劑 +3 | 聽風就是雨； 2026-03-16 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 東南大學364求調(diào)劑 +5 | JasonYuiui 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 326求調(diào)劑 +4 | 諾貝爾化學獎覬?/a> 2026-03-15 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 285求調(diào)劑 +6 | ytter 2026-03-12 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 一志愿華中師范071000，325求調(diào)劑 +6 | RuitingC 2026-03-12 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 255求調(diào)劑 +3 | 李嘉慧， 2026-03-12 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 復試調(diào)劑 +4 | z1z2z3879 2026-03-14 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 材料與化工（0856）304求B區(qū)調(diào)劑 +6 | 邱gl 2026-03-12 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 281求調(diào)劑 +9 | Koxui 2026-03-12 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 26調(diào)劑/材料科學與工程/總分295/求收留 +9 | 2026調(diào)劑俠 2026-03-12 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +3 | 程雨杭 2026-03-12 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 081200-11408-276學碩求調(diào)劑 +3 | 崔wj 2026-03-12 | 4/200 |
|