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wx3266626銀蟲 (小有名氣)
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求Packmol安裝指導(dǎo) 已有1人參與
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| 在用amber教程中（A15），有一個(gè)Packmol版塊的使用，自己不了解怎么安裝，初學(xué)者還望多多指教！教程上面只提供了一個(gè)網(wǎng)站：http://www.ime.unicamp.br/~martinez/packmol/ |
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| packmol的安裝很簡(jiǎn)單的。先解壓壓縮文件，然后make 一下就可以了！這個(gè)可以參考packmol的官網(wǎng)，手冊(cè)上面有很詳細(xì)的介紹！你可以看看！ |
2樓2015-01-30 20:37:58
wangyulinup
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3樓2015-01-31 12:45:49
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請(qǐng)問這樣算安裝成功了嗎？ ------------------------------------------------------ Compiling packmol with /usr/bin/gfortran Flags: -O3 -ffast-math ------------------------------------------------------ Packmol succesfully built. ------------------------------------------------------ 為什么輸入命令 packmol < input.inp后還會(huì)出現(xiàn)： If 'packmol' is not a typo you can run the following command to lookup the package that contains the binary: command-not-found packmol -bash: packmol: command not found 謝謝解答~ |
5樓2015-01-31 15:14:40
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7樓2015-01-31 16:26:27
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8樓2015-01-31 16:34:52
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提示信息如下： ############################################################## PACKMOL - Packing optimization for the automated generation of starting configurations for molecular dynamics. Version 14.225 ############################################################## Packmol must be run with: packmol < inputfile.inp Userguide at: www.ime.unicamp.br/~martinez/packmol Reading input file... (Control-C aborts) Seed for random number generator: 19128787 Output file: ionic2.pdb Reading coordinate file: BF4.gjf.g03.log At line 258 of file io.f (unit = 10, file = 'BF4.gjf.g03.log') Fortran runtime error: End of file 請(qǐng)問這是哪里出錯(cuò)了，謝謝您了~ |
9樓2015-01-31 17:12:17
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10樓2015-01-31 17:15:02
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