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zhangmao511鐵蟲 (小有名氣)
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[求助]
求助，請(qǐng)問有預(yù)測(cè)ORF的軟件嗎？？謝謝！ 已有2人參與
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| 請(qǐng)教各位大蝦，請(qǐng)問有預(yù)測(cè)ORF的軟件嗎，需要是windows版本的，而且是可以下載到本地的（不是那種網(wǎng)頁(yè)版的，我知道NCBI有ORF FINDER，但是在線的，無(wú)法下載）？？在GOOGLE上翻了好久都沒找，在這里請(qǐng)教大家了，希望能給點(diǎn)提示（只要說出名字，我自己在網(wǎng)上搜下，但是希望真的能下載下來(lái)）,謝謝�。� |
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jiqinger
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
zhangmao511(西門吹雪170代發(fā)): 金幣+2, 鼓勵(lì)回帖交流 2015-02-26 22:38:45
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zhangmao511(西門吹雪170代發(fā)): 金幣+2, 鼓勵(lì)回帖交流 2015-02-26 22:38:45
| bioxm，本軟件用于DNA序列資料的常規(guī)分析,包括ORF查找, 序列格式化, 翻譯, 蛋白質(zhì)分子量和等電點(diǎn)的計(jì)算, 限制酶酶切位點(diǎn)分析,引物輔助設(shè)計(jì)等,另外還提供了序列格式文件的批量轉(zhuǎn)換工具,引物濃度計(jì)算工具,酶切位點(diǎn)查詢工具,自動(dòng)去載體序列工具, |
2樓2015-02-25 18:08:38
daniel1112
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3樓2015-02-26 05:25:13
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十分感謝你的回答，我看了一下geneious，vector nti，這2個(gè)軟件貌似是一個(gè)比較大的客戶端界面式軟件，ORF FIND只是這個(gè)軟件中其中的一個(gè)功能。也怪我一開始沒表述清楚，我是想找一個(gè)命令行式的ORF FIND的軟件（主要就是）。因?yàn)槲易约涸谧鲆粋�(gè)WORKFLOW的軟件，想把預(yù)測(cè)ORF的功能植入進(jìn)去，所以想找一個(gè)現(xiàn)成軟件植入進(jìn)去。而命令行式的程序（GeneMark不知道你聽說過沒，類似JAR包的，或者XXX.exe后面跟參數(shù)的）比較容易植入，而界面版的大軟件很難嵌入，我也只需要一個(gè)預(yù)測(cè)ORF的功能。其實(shí)LINUX或者WINDOWS版也無(wú)所謂了，不知道有什么推薦嗎？？謝謝 |
4樓2015-02-26 11:11:02
zhangmao511
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十分感謝你的回答，我看了一下bioxm，這個(gè)軟件貌似是一個(gè)比較大的客戶端界面式軟件，ORF FIND只是這個(gè)軟件中其中的一個(gè)功能。也怪我一開始沒表述清楚，我是想找一個(gè)命令行式的ORF FIND的軟件（主要就是）。因?yàn)槲易约涸谧鲆粋�(gè)WORKFLOW的軟件，想把預(yù)測(cè)ORF的功能植入進(jìn)去，所以想找一個(gè)現(xiàn)成軟件植入進(jìn)去。而命令行式的程序（GeneMark不知道你聽說過沒，類似JAR包的，或者XXX.exe后面跟參數(shù)的）比較容易植入，而界面版的大軟件很難嵌入，我也只需要一個(gè)預(yù)測(cè)ORF的功能。其實(shí)LINUX或者WINDOWS版也無(wú)所謂了，不知道有什么推薦嗎？？謝謝 |
5樓2015-02-26 11:12:15
jiqinger
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7樓2015-02-26 19:56:19
daniel1112
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8樓2015-02-26 23:06:55
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9樓2015-02-27 18:23:53
zhangmao511
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10樓2015-03-03 17:44:19
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