 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 3 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1722 | 回復(fù): 2 | |||
[交流]
VASP計(jì)算任務(wù)中斷，原因是reason = mpd disappeared,求解決辦法。
|
|
VASP計(jì)算一個(gè)任務(wù)，用計(jì)算機(jī)提交服務(wù)器進(jìn)行計(jì)算，然后將SSH窗口關(guān)掉之后，再次登錄任務(wù)就無故終端，log文件最后提示job aborted; reason = mpd disappeared。提交任務(wù)之前都需要在窗口上鍵入mpd &才能進(jìn)行計(jì)算，之前求助過這個(gè)問題，是因?yàn)閙pd不能自動(dòng)啟動(dòng)，需要手動(dòng)啟動(dòng)，但是為什么前端關(guān)閉，任務(wù)就結(jié)束了呢？我提交任務(wù)的命令是nohup mpirun -np 12 vaspmpi </dev/dull> log &, 已經(jīng)讓其后臺(tái)運(yùn)行了，為什么還中斷呢？有人回答cannot connect to local mpd (/tmp/mpd2.console_hf); possible causes: 1. no mpd is running on this host 2. an mpd is running but was started without a "console" (-n option)In case 1, you can start an mpd on this host with: mpd & and you will be able to run jobs just on this host. 有人說我的并行安裝有問題或者設(shè)置有問題，我安裝MPI的步驟如下： MPI（mpich2-1.0.8）安裝： 1. 進(jìn)入進(jìn)入指定目錄/home/vasp52/mpi/（目錄可以更改）下，進(jìn)入后打開終端，輸入以下命令進(jìn)行安裝： 解壓 tar -zxvf mpich2-1.0.8.tar.gz（請使用這個(gè)版本，使用1.4版沒有編譯過）。 2. 進(jìn)入安裝包 cd mpich2-1.0.8 3. 輸入命令 export F90=ifort FC=ifort 4. 檢查環(huán)境指定目錄 ./configure --prefix=/home/vasp52/mpich2/ --enable-f90 --enable-f77 （在configure的過程可能出現(xiàn)說域名錯(cuò)誤，那就修改/etc/hosts文件） 5. 進(jìn)行編譯 make 6. 編譯安裝 make install 7. 修改環(huán)境變量 vi ~/.bashrc，加入以下兩句 export PATH=/home/vasp/mpich2/bin/:$PATH export LD_LIBRARY_PATH=/home/vasp/mpich2/lib/:$LD_LIBRARY_PATH ulimit -s unlimited 8. 保存 source ~/.bashrc。 9. 輸入命令： cd $HOME touch /etc/mpd.conf chmod 600 /etc/mpd.conf vi /etc/mpd.conf進(jìn)入文本文檔，輸入secretword=123456（數(shù)字可以隨意），保存退出。 再輸入命令： mpd &就OK了。 輸入以下命令：which mpd which mpiexec which mpdrun 能找到相對應(yīng)的路徑就說明沒問題了。 求大神指點(diǎn)具體改進(jìn)的方法！感激不盡！ 上一次求助的鏈接http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=8257344&fpage=1&target=self&page=1 |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
一志愿重慶大學(xué)085700資源與環(huán)境，總分308求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
接收2026碩士調(diào)劑(學(xué)碩+專碩)
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
081700 調(diào)劑 267分
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
328求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
0854 考研調(diào)劑 招生了！AI 方向
已經(jīng)有14人回復(fù)
-
招08考數(shù)學(xué)
已經(jīng)有14人回復(fù)
-
一志愿上海交大生物與醫(yī)藥專碩324分，求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
0854電子信息求調(diào)劑 324
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
303求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
336求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對您同樣有幫助:
- VASP計(jì)算任務(wù)中斷，顯示 reason = mpd disappeared，是什么原因呢？
已經(jīng)有20人回復(fù)
2樓2015-04-28 09:02:25
KalaShayminS
鐵桿木蟲 (著名寫手)
- 應(yīng)助: 432 (碩士)
- 金幣: 6174.2
- 紅花: 56
- 帖子: 1088
- 在線: 379小時(shí)
- 蟲號(hào): 2408111
- 注冊: 2013-04-08
3樓2015-04-28 09:16:09
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 天罡寒星 的主題更新
| 3 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 276求調(diào)劑。有半年電池和半年高分子實(shí)習(xí)經(jīng)歷 +8 | 材料學(xué)257求調(diào)劑 2026-03-23 | 9/450 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 一志愿北京化工大學(xué) 070300 學(xué)碩 336分 求調(diào)劑 +5 | vv迷 2026-03-22 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 310求調(diào)劑 +4 | baibai1314 2026-03-16 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 289材料與化工（085600）B區(qū)求調(diào)劑 +3 | 這么名字咋樣 2026-03-22 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +6 | 十三加油 2026-03-21 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 260求調(diào)劑 +3 | 朱芷琳 2026-03-20 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +7 | Auroracx 2026-03-22 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 考研調(diào)劑 +3 | 呼呼？~+123456 2026-03-21 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 336求調(diào)劑 +5 | rmc8866 2026-03-21 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 330求調(diào)劑0854 +3 | assdll 2026-03-21 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 307求調(diào)劑 +3 | wyyyqx 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 299求調(diào)劑 +6 | △小透明* 2026-03-17 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +3 | Ma_xt 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 22408 344分 求調(diào)劑 一志愿 華電計(jì)算機(jī)技術(shù) +4 | solanXXX 2026-03-20 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 295求調(diào)劑 +4 | 一志愿京區(qū)211 2026-03-18 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 一志愿南昌大學(xué)，327分，材料與化工085600 +9 | Ncdx123456 2026-03-19 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 295材料求調(diào)劑，一志愿武漢理工085601專碩 +5 | Charlieyq 2026-03-19 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 材料學(xué)碩318求調(diào)劑 +5 | February_Feb 2026-03-19 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 材料，紡織，生物（0856、0710），化學(xué)招生啦 +3 | Eember. 2026-03-17 | 9/450 |
|
|
|
[考博] 26博士申請 +3 | 1042136743 2026-03-17 | 3/150 |
|