 |
 |
 |
| 24小時(shí)熱門(mén)版塊排行榜 |
- >論壇更新日志 (5965)
- >導(dǎo)師招生 (1220)
- >考研 (1065)
- >文獻(xiàn)求助 (489)
- >蟲(chóng)友互識(shí) (295)
- >考博 (204)
- >休閑灌水 (182)
- >基金申請(qǐng) (180)
- >碩博家園 (136)
- >招聘信息布告欄 (104)
- >博后之家 (90)
- >綠色求助(高懸賞) (51)
- >論文投稿 (45)
- >找工作 (40)
- >SciFinder/Reaxys (24)
- >外文書(shū)籍求助 (19)
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 3 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1723 | 回復(fù): 2 | |||
[交流]
VASP計(jì)算任務(wù)中斷，原因是reason = mpd disappeared,求解決辦法。
|
|
VASP計(jì)算一個(gè)任務(wù)，用計(jì)算機(jī)提交服務(wù)器進(jìn)行計(jì)算，然后將SSH窗口關(guān)掉之后，再次登錄任務(wù)就無(wú)故終端，log文件最后提示job aborted; reason = mpd disappeared。提交任務(wù)之前都需要在窗口上鍵入mpd &才能進(jìn)行計(jì)算，之前求助過(guò)這個(gè)問(wèn)題，是因?yàn)閙pd不能自動(dòng)啟動(dòng)，需要手動(dòng)啟動(dòng)，但是為什么前端關(guān)閉，任務(wù)就結(jié)束了呢？我提交任務(wù)的命令是nohup mpirun -np 12 vaspmpi </dev/dull> log &, 已經(jīng)讓其后臺(tái)運(yùn)行了，為什么還中斷呢？有人回答cannot connect to local mpd (/tmp/mpd2.console_hf); possible causes: 1. no mpd is running on this host 2. an mpd is running but was started without a "console" (-n option)In case 1, you can start an mpd on this host with: mpd & and you will be able to run jobs just on this host. 有人說(shuō)我的并行安裝有問(wèn)題或者設(shè)置有問(wèn)題，我安裝MPI的步驟如下： MPI（mpich2-1.0.8）安裝： 1. 進(jìn)入進(jìn)入指定目錄/home/vasp52/mpi/（目錄可以更改）下，進(jìn)入后打開(kāi)終端，輸入以下命令進(jìn)行安裝： 解壓 tar -zxvf mpich2-1.0.8.tar.gz（請(qǐng)使用這個(gè)版本，使用1.4版沒(méi)有編譯過(guò)）。 2. 進(jìn)入安裝包 cd mpich2-1.0.8 3. 輸入命令 export F90=ifort FC=ifort 4. 檢查環(huán)境指定目錄 ./configure --prefix=/home/vasp52/mpich2/ --enable-f90 --enable-f77 （在configure的過(guò)程可能出現(xiàn)說(shuō)域名錯(cuò)誤，那就修改/etc/hosts文件） 5. 進(jìn)行編譯 make 6. 編譯安裝 make install 7. 修改環(huán)境變量 vi ~/.bashrc，加入以下兩句 export PATH=/home/vasp/mpich2/bin/:$PATH export LD_LIBRARY_PATH=/home/vasp/mpich2/lib/:$LD_LIBRARY_PATH ulimit -s unlimited 8. 保存 source ~/.bashrc。 9. 輸入命令： cd $HOME touch /etc/mpd.conf chmod 600 /etc/mpd.conf vi /etc/mpd.conf進(jìn)入文本文檔，輸入secretword=123456（數(shù)字可以隨意），保存退出。 再輸入命令： mpd &就OK了。 輸入以下命令：which mpd which mpiexec which mpdrun 能找到相對(duì)應(yīng)的路徑就說(shuō)明沒(méi)問(wèn)題了。 求大神指點(diǎn)具體改進(jìn)的方法！感激不盡！ 上一次求助的鏈接http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=8257344&fpage=1&target=self&page=1 |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
一志愿陜師大生物學(xué)071000，298分，求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
306求0703調(diào)劑一志愿華中師范
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
333求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
335求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
336求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
303求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
085600材料與化工調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
291求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
0703化學(xué)求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
07化學(xué)280分求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- VASP計(jì)算任務(wù)中斷，顯示 reason = mpd disappeared，是什么原因呢？
已經(jīng)有20人回復(fù)
2樓2015-04-28 09:02:25
KalaShayminS
鐵桿木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
- 應(yīng)助: 432 (碩士)
- 金幣: 6174.2
- 紅花: 56
- 帖子: 1088
- 在線(xiàn): 379小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 2408111
- 注冊(cè): 2013-04-08
3樓2015-04-28 09:16:09
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 天罡寒星 的主題更新
| 3 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 一志愿中國(guó)石油大學(xué)（華東） 本科齊魯工業(yè)大學(xué) +4 | 石能偉 2026-03-17 | 4/200 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 306求調(diào)劑 +9 | chuanzhu川燭 2026-03-18 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 276求調(diào)劑 +3 | YNRYG 2026-03-21 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 280分求調(diào)劑 一志愿085802 +4 | PUMPT 2026-03-22 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 材料與化工085600，總分304，本科有兩篇sci參與，求調(diào)劑 +4 | 幸運(yùn)的醬醬 2026-03-22 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 315分，誠(chéng)求調(diào)劑，材料與化工085600 +3 | 13756423260 2026-03-22 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿北京化工大學(xué)070300 學(xué)碩336求調(diào)劑 +5 | vv迷 2026-03-21 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +5 | Zhangbod 2026-03-21 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 考研調(diào)劑 +4 | 來(lái)好運(yùn)來(lái)來(lái)來(lái) 2026-03-21 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 354求調(diào)劑 +7 | Tyoumou 2026-03-18 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 384求調(diào)劑 +3 | 子系博 2026-03-22 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 廣西大學(xué)材料導(dǎo)師推薦 +3 | 夏夏夏小正 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +3 | 13341 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿重慶大學(xué)085700資源與環(huán)境總分308求調(diào)劑 +7 | 墨墨漠 2026-03-20 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 材料學(xué)學(xué)碩080502 337求調(diào)劑-一志愿華中科技大學(xué) +4 | 順順順mr 2026-03-18 | 5/250 |
|
|
|
[考研]
 材料與化工 322求調(diào)劑
+4
|
然11 2026-03-19 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿吉林大學(xué)材料學(xué)碩321求調(diào)劑 +11 | Ymlll 2026-03-18 | 15/750 |
|
|
|
[考研] 一志愿中國(guó)海洋大學(xué)，生物學(xué)，301分，求調(diào)劑 +5 | 1孫悟空 2026-03-17 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 288求調(diào)劑，一志愿華南理工大學(xué)071005 +5 | ioodiiij 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 +4 | 18889395102 2026-03-18 | 4/200 |
|