 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1572 | 回復(fù): 9 | ||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話題的所有回帖 | ||
fcff123新蟲 (初入文壇)
|
[求助]
系統(tǒng)發(fā)育樹(shù) 已有6人參與
|
|
|
各位同仁大家好： 本人本科時(shí)學(xué)園林，研究生突然轉(zhuǎn)戰(zhàn)內(nèi)生菌，現(xiàn)在建一個(gè)系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)，可是做出來(lái)有點(diǎn)怪，用DNAman做的，可是分支不明顯，bootstrap 10000次，是不是我選擇的同源性的序列有問(wèn)題，現(xiàn)在急著分析，希望大家?guī)臀铱纯磫?wèn)題出在什么地方了，小女子不勝感激！ DXE}13D5KDB)6I552BZOMGI.png |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)中的趣事：實(shí)驗(yàn)器材的 “烏龍”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)中的趣事：和實(shí)驗(yàn)材料的 “斗智斗勇”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
化學(xué)工程及工業(yè)化學(xué)論文潤(rùn)色/翻譯怎么收費(fèi)?
已經(jīng)有293人回復(fù)
-
蛋白質(zhì)檢測(cè)：精準(zhǔn)分析，解鎖生物分子的密碼
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)之小鼠實(shí)驗(yàn)：嚴(yán)謹(jǐn)設(shè)計(jì)，解析生命機(jī)制的重要載體
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)之重金屬檢測(cè)：精準(zhǔn)篩查，守護(hù)健康與環(huán)境的防線
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)之“蛙測(cè)重金屬我背鍋三千”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)之“鼠逃三次我發(fā)三篇SCI”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
納米粒度分析
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
林科院林化所招收材料與化工專業(yè)碩士，坐標(biāo)南京
已經(jīng)有0人回復(fù)
4樓2015-03-31 18:25:25
444565008qq
新蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 11 (小學(xué)生)
- 金幣: 389
- 散金: 2
- 紅花: 1
- 帖子: 135
- 在線: 41.1小時(shí)
- 蟲號(hào): 3536386
- 注冊(cè): 2014-11-14
- 專業(yè): 分子與進(jìn)化生態(tài)學(xué)
2樓2015-03-31 15:45:09
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
kx444555: 金幣+3, 鼓勵(lì)交流 2015-05-28 08:32:12
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
kx444555: 金幣+3, 鼓勵(lì)交流 2015-05-28 08:32:12
| 你這附圖太小了吧，不好看出啥。。。bootstrap replication 1000就夠了，不過(guò)這個(gè)應(yīng)該影響不大，分支不明顯除了和序列的選擇有關(guān)，也和你建樹(shù)的方法有一點(diǎn)相關(guān)，可以嘗試用不同的算法建樹(shù)，序列的選擇可以選擇和它相似性高的多種菌屬還有模式生物，常見(jiàn)的菌屬都可以。其次也要注意下進(jìn)化距離和bootstrap值，比如通常進(jìn)化距離為0.000然后bootstrap值為100或者99的說(shuō)明選的這兩個(gè)序列是同一個(gè)東西，可以剔除掉一個(gè)，這樣之后做的進(jìn)化樹(shù)就會(huì)比較準(zhǔn)一點(diǎn)，還有就是最好不要選擇序列長(zhǎng)度差異太大的，譬如10個(gè)序列有8個(gè)長(zhǎng)度差不多，但是有2個(gè)小很多的，這樣你做出來(lái)的樹(shù)也是有問(wèn)題的。除非如果是客觀就有差異的話。 |
3樓2015-03-31 16:21:14
5樓2015-03-31 18:27:07
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 287求調(diào)劑 +4 | 晨昏線與星海 2026-03-19 | 5/250 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[基金申請(qǐng)]
學(xué)校已經(jīng)提交到NSFC，還能修改嗎？
 40+4
|
babangida 2026-03-19 | 8/400 |
|
|
|
[考研]
 295復(fù)試調(diào)劑
+7
|
簡(jiǎn)木ChuFront 2026-03-19 | 7/350 |
|
|
[考研] 一志愿武漢理工材料工程專碩調(diào)劑 +7 | Doleres 2026-03-19 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 材料專碩英一數(shù)二306 +6 | z1z2z3879 2026-03-18 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 328求調(diào)劑，英語(yǔ)六級(jí)551，有科研經(jīng)歷 +4 | 生物工程調(diào)劑 2026-03-16 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué) 305求調(diào)劑 +4 | FY_yy 2026-03-14 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 344求調(diào)劑 +6 | knight344 2026-03-16 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 一志愿西南交大，求調(diào)劑 +4 | 材化逐夢(mèng)人 2026-03-18 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 268求調(diào)劑 +6 | 簡(jiǎn)單點(diǎn)0 2026-03-17 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 301求調(diào)劑 +9 | yy要上岸呀 2026-03-17 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 278求調(diào)劑 +5 | 煙火先于春 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 334求調(diào)劑 +3 | 志存高遠(yuǎn)意在機(jī)?/a> 2026-03-16 | 3/150 |
|
|
|
[考博] 26博士申請(qǐng) +3 | 1042136743 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 302求調(diào)劑 +4 | 小賈同學(xué)123 2026-03-15 | 8/400 |
|
|
|
[考研] [導(dǎo)師推薦]西南科技大學(xué)國(guó)防/材料導(dǎo)師推薦 +3 | 尖角小荷 2026-03-16 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 321求調(diào)劑 +5 | 大米飯！ 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 0856求調(diào)劑 +3 | 劉夢(mèng)微 2026-03-15 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 326求調(diào)劑 +3 | mlpqaz03 2026-03-15 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿哈工大材料324分求調(diào)劑 +5 | 閆旭東 2026-03-14 | 5/250 |
|