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系統(tǒng)發(fā)育樹 已有6人參與
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新蟲 (小有名氣)
| 你這附圖太小了吧,不好看出啥。。。bootstrap replication 1000就夠了,不過這個應該影響不大,分支不明顯除了和序列的選擇有關,也和你建樹的方法有一點相關,可以嘗試用不同的算法建樹,序列的選擇可以選擇和它相似性高的多種菌屬還有模式生物,常見的菌屬都可以。其次也要注意下進化距離和bootstrap值,比如通常進化距離為0.000然后bootstrap值為100或者99的說明選的這兩個序列是同一個東西,可以剔除掉一個,這樣之后做的進化樹就會比較準一點,還有就是最好不要選擇序列長度差異太大的,譬如10個序列有8個長度差不多,但是有2個小很多的,這樣你做出來的樹也是有問題的。除非如果是客觀就有差異的話。 |



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