 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1581 | 回復(fù): 9 | ||
| 當前只顯示滿足指定條件的回帖，點擊這里查看本話題的所有回帖 | ||
fcff123新蟲 (初入文壇)
|
[求助]
系統(tǒng)發(fā)育樹 已有6人參與
|
|
|
各位同仁大家好： 本人本科時學(xué)園林，研究生突然轉(zhuǎn)戰(zhàn)內(nèi)生菌，現(xiàn)在建一個系統(tǒng)發(fā)育樹，可是做出來有點怪，用DNAman做的，可是分支不明顯，bootstrap 10000次，是不是我選擇的同源性的序列有問題，現(xiàn)在急著分析，希望大家?guī)臀铱纯磫栴}出在什么地方了，小女子不勝感激！ DXE}13D5KDB)6I552BZOMGI.png |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
不合理蛙科研實驗中的趣事：實驗器材的 “烏龍”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實驗中的趣事：和實驗材料的 “斗智斗勇”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
化學(xué)工程及工業(yè)化學(xué)論文潤色/翻譯怎么收費?
已經(jīng)有185人回復(fù)
-
蛋白質(zhì)檢測：精準分析，解鎖生物分子的密碼
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實驗之小鼠實驗：嚴謹設(shè)計，解析生命機制的重要載體
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實驗之重金屬檢測：精準篩查，守護健康與環(huán)境的防線
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實驗之“蛙測重金屬我背鍋三千”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實驗之“鼠逃三次我發(fā)三篇SCI”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
納米粒度分析
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
林科院林化所招收材料與化工專業(yè)碩士，坐標南京
已經(jīng)有0人回復(fù)
6樓2015-03-31 18:30:27
444565008qq
新蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 11 (小學(xué)生)
- 金幣: 389
- 散金: 2
- 紅花: 1
- 帖子: 135
- 在線: 41.1小時
- 蟲號: 3536386
- 注冊: 2014-11-14
- 專業(yè): 分子與進化生態(tài)學(xué)
2樓2015-03-31 15:45:09
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
kx444555: 金幣+3, 鼓勵交流 2015-05-28 08:32:12
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
kx444555: 金幣+3, 鼓勵交流 2015-05-28 08:32:12
| 你這附圖太小了吧，不好看出啥。。。bootstrap replication 1000就夠了，不過這個應(yīng)該影響不大，分支不明顯除了和序列的選擇有關(guān)，也和你建樹的方法有一點相關(guān)，可以嘗試用不同的算法建樹，序列的選擇可以選擇和它相似性高的多種菌屬還有模式生物，常見的菌屬都可以。其次也要注意下進化距離和bootstrap值，比如通常進化距離為0.000然后bootstrap值為100或者99的說明選的這兩個序列是同一個東西，可以剔除掉一個，這樣之后做的進化樹就會比較準一點，還有就是最好不要選擇序列長度差異太大的，譬如10個序列有8個長度差不多，但是有2個小很多的，這樣你做出來的樹也是有問題的。除非如果是客觀就有差異的話。 |
3樓2015-03-31 16:21:14
4樓2015-03-31 18:25:25
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
