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[求助]
用MS如何構(gòu)建交聯(lián)反應(yīng)？？？ 急求 謝謝各位大神
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構(gòu)建所用單體為雙酚A型環(huán)氧樹(shù)脂和固化劑異佛爾酮二胺， 1，文獻(xiàn)說(shuō)在構(gòu)建三維分子結(jié)構(gòu)時(shí)，要對(duì)能量?jī)?yōu)化后的分子結(jié)構(gòu)進(jìn)行開(kāi)環(huán)處理及移出末端的活性氫，我是直接移出要移除的原子，不知道正確不正確？？？ 2，在構(gòu)建三維分子結(jié)構(gòu)時(shí)，所用的單體是不是必須是分子型的，我把單體末端的活性氫移出之后，在構(gòu)建時(shí)，總是說(shuō)任務(wù)失��？？？ 3，在構(gòu)建時(shí)，交聯(lián)反應(yīng)是在如何的操作下進(jìn)行的？？？ 雙酚A型環(huán)氧樹(shù)脂（DGEBA）.png 異佛爾酮二胺（IPD）.png |
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4樓2020-05-30 16:26:43
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第一步：構(gòu)建交聯(lián)環(huán)氧樹(shù)脂聚合物模型。 （1）基于一個(gè)原子一個(gè)原子的方式建立DGEBA和IPD單體的二維活性結(jié)構(gòu)模型。利用MS Discover模塊分別對(duì)其進(jìn)行能量最小化計(jì)算，優(yōu)化初始分子結(jié)構(gòu)的能量以獲得合理的三維分子結(jié)構(gòu)。對(duì)能量?jī)?yōu)化后的分子結(jié)構(gòu)進(jìn)行開(kāi)環(huán)處理并移除末端官能基團(tuán)上的活性氫，剩下含有碳和氧反應(yīng)位點(diǎn)的分子片段用于下一步建立初始的周期性三維分子結(jié)構(gòu)。開(kāi)環(huán)處理后，非端基活性氧反應(yīng)位點(diǎn)需進(jìn)行加氫處理，使其成為羥基。 （2）在MS Amorphous Cell模塊中按照反應(yīng)基團(tuán)2：1的化學(xué)計(jì)量比將16條DGEBA分子鏈和8條IPD分子鏈放入預(yù)先定義好的三維盒子內(nèi)。所用的方法是Theodorou和Suter提出的“隨機(jī)自避行走”方法。 這是我摘抄的一點(diǎn)操作步驟，希望大神幫忙 |
2樓2015-04-17 18:47:28
pigrass
專(zhuān)家顧問(wèn) (著名寫(xiě)手)
伊卡斯特的小豬
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專(zhuān)家經(jīng)驗(yàn): +503 - 模擬EPI: 4
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- 專(zhuān)業(yè): 高分子材料結(jié)構(gòu)與性能
- 管轄: 分子模擬
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1、self-avoiding walk（SAW）在AC模塊的一篇參考文獻(xiàn)有提到這個(gè)，不知道AC模塊會(huì)不會(huì)默認(rèn)支持SAW，除了這個(gè)reference提到，其他地方?jīng)]找到這個(gè)關(guān)鍵詞 Meirovitch, H.J. "Computer Simulation of Self-Avoiding Walks: Testing the Scanning Method", J. Chem. Phys., 79, 502 (1983). 2、交聯(lián)過(guò)程我覺(jué)得和這個(gè)思路相近 http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=8449329 活性分子放入AC晶胞，鄰近的活性點(diǎn)手動(dòng)交聯(lián) |
3樓2015-04-20 08:57:56
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